【摘 要】
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本团队前期历时14年,在我国细毛羊重要产区—天祝藏族自治县,创制出含62.5%南非肉用美利奴羊、37.5%甘肃高山细毛羊血液的新种质并完成横交,培育肉毛兼用的新品种—天华肉用美利奴羊（Tianhua mutton merino,TZ）。本论文从mtDNA、Y染色体基因和常染色体基因组三个方面研究TZ横交固定后代的遗传多样性,并筛选与经济性状关联的分子标记,以期为新品种的育种提供指导。本论文的主要研
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本团队前期历时14年,在我国细毛羊重要产区—天祝藏族自治县,创制出含62.5%南非肉用美利奴羊、37.5%甘肃高山细毛羊血液的新种质并完成横交,培育肉毛兼用的新品种—天华肉用美利奴羊（Tianhua mutton merino,TZ）。本论文从mtDNA、Y染色体基因和常染色体基因组三个方面研究TZ横交固定后代的遗传多样性,并筛选与经济性状关联的分子标记,以期为新品种的育种提供指导。本论文的主要研究结果如下:（1）测定了 84只TZ的mtDNAD-loop,并和15只甘肃高山细毛羊（Gansu alpine fine wool sheep,GX）、11 只南非肉用美利奴羊（South Africa muttonmerino,SM）、14只高山美利奴羊（Alpinemerino,GSM）和16只青海细毛羊（Qinghai fine wool sheep,QHM）的D-loop序列进行联合分析,共鉴定到79个单倍型;其中TZ有56个单倍型,43个为特有单倍型;TZ的核苷酸多样度为0.039,单倍型多样度为0.980;系统发育树分析发现TZ与QHM、GSM和GX聚集在一起,SM群体中大部分个体单独聚集为一类。（2）利用45对Y染色体引物对212只TZ（n=195）、SM（n=11）和GX（n=6）公羊群体进行SNPs研究,鉴定到4个Y-SNPs,包括DDX3Y5:g.688 A＞G、SRY16:g.3116C＞T、ZFY16:g.904C＞T、EIF2S3Y6:g.101435A＞G。关联分析发现其中3个Y-SNPs显著影响TZ周岁的阴囊围;位点联合分析在TZ群体中构建了 11个Y单倍型,其中单倍型GTCG为主要的单倍型,并且单倍型对TZ阴囊围也有显著影响。（3）对 120 只绵羊（TZ（n=98）、SM（n=11）和 GX（n=11））进行基因组重测序,主成分分析（Principal components analysis,PCA）、群体结构和系统发育树分析发现TZ与GX和SM能分开,基本独立成为一支。全基因组关联分析（Genome-wide association studies,GWAS）筛选到 37 个与经济性状相关的 SNPs,其中有8个SNPs与体重、体尺性状显著相关,5个SNPs与活体背膘厚、眼肌面积和眼肌厚性状显著相关,24个SNPs与毛长和污毛量显著相关。基因注释发现显著关联 SNPs 主要位于MAN2A1、TIGD4、TMEM154、GTF3C1、COL4A1、FAM3D、APPL2、KCNMA1、RAC2、IGFBP3、POMC、RBFOX3 等基因。功能注释表明这些基因主要与蛋白质消化吸收、脂质转运、调节离子跨膜运输、细胞增殖的正调控等通路相关。综上,本研究发现天华肉用美利奴羊新品种群体具有丰富的母系遗传多样性;鉴定到4个Y-SNPs,其中3个与公羊阴囊围显著相关,构建了 11个Y单倍型并且Y单倍型对公羊阴囊围也有显著影响;基于GWAS筛选到37个与体重、体尺、产毛、产肉性状相关的SNPs,为新品种的培育提供了可靠的分子标记。
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