电子政务信息资源的整合既是对社会公平、政府过程公开及公共参与的关照，同时也是对治理理论内核的完美彰显。通过开展信息资源的整合工作带动资源共享、部门协同，促进政府机构设置、职能配置和工作流程的不断优化，完善决策权、执行权、监督权既相互制约又相互协调的权力运行机制，从而保障公众的知情权、参与权与监督权，以此实现对公共利益和公共关怀的最高诉求。当前我国电子政务信息资源整合工作局限于对后台技术的更新和前台服务的建设，缺乏对整合背后官僚式机构设置、孤立的组织功能和单一化业务流程的整体性考虑。因而，迫切需要加强电子政务信息资源整合理论的开发与研究，构建全面的整合机制和绩效评估体系。基于此，从电子政务信息资源整合的相关概念、现状及评价的必要性出发，论述了整体性治理的理论渊源和发展，挖掘了整体性治理与整合概念的逻辑关系，进而逐一剖析了整体性治理视角下电子政务信息资源整合评价的要素，构建了针对整合绩效的评价指标体系。最后，以“中国南京”网站群为例，对其整合绩效进行了评估和分析，以验证该指标体系的可行性和全面性。研究结果表明：首先，实现电子政务信息资源整合，不仅需要加强包括数据库、信息系统、服务平台等的整合，更应该重视政府组织机构的跨边界业务协同能力和资源共享能力等组织机构层面的整合；其次，组织机构层面整合的不足是当前制约我国政务信息整合和服务整合的主要因素；最后，整合工作的开展能够有效促进政府机构设置、职能配置和工作流程的不断优化，有助于推进国家治理体系和治理能力现代化。