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本研究利用PCR和PCR-SSCP技术对大白猪、长白猪、杜洛克、辽宁黑猪、丹育黑猪5个猪群共167头的BMP15基因、GDF9基因和FSHβ亚基基因检测多态性,研究基因和猪产仔数之间的关系。利用GenBank上已经发表的猪的基因序列设计引物,进行PCR扩增并测序,多态分析,和对两个插入序列进行生物信息学分析,并对产仔数建立GLM模型,探讨两个多态性与猪产仔数的关系。结果表明:(1)BMP15基因的多态性检测:设计2条引物(引物1和引物2)扩增,共检测到3个突变: 5582C/T(TCC-TCT)、6031 T/C (AAT-AAC)和6056C/T (AAC-AAT)。6031 T/C (AAT-AAC),为同意突变,在辽宁黑猪中检测到T。(2)GDF9基因的多态性检测及与产仔数性状的相关性分析:设计5条引物(引物3、引物4、引物5、引物6和引物7)扩增,引物3序列检测到1个约300bp序列的插入/缺失多态。引物4序列检测到辽宁黑猪存在2个杂合突变:3422C/T,其它猪种均为C;3427 C/T,其它猪种均为T,且这两个突变距离很近。引物5序列检测到2个多态:辽宁黑猪存在杂合,其它猪均为纯和。引物6序列检测到6个多态,其中还有1个杜洛克3bp序列的缺失。引物7序列的突变同引物6,设计短序列主要为了使用SSCP技术检测品种间差异。对插入/缺失多态与产仔数进行相关性分析,研究表明不同品种、胎次、基因型,产仔数不同基因型之间差异不显著(P>0.05)。(3)FSHβ基因的多态性检测及与产仔数性状的相关性分析:设计1条引物扩增,发现存在1个约300bp序列的插入/缺失多态。本研究表明不同品种、胎次、基因型,产仔数差异极显著(P<0.01),BB型纯合子比AA型纯合子多产1.3头。(4)GDF9基因和FSHβ基因Alu序列插入/缺失的多态性与产仔数性状的相关性分析:使用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction ,PCR)对辽宁黑猪、长白、大约克、丹育猪和杜洛克的FSHβ亚基基因和GDF9基因的插入片段扩增进行多态分析,和对两个插入序列进行生物信息学分析,并对产仔数建立GLM模型,探讨两个多态性与猪产仔数的关系。结果发现FSHβ亚基基因和GDF9基因以某种方式相互结合影响猪产仔数,这可能会作为猪产仔数性状的遗传标记。首次证明FSHβ亚基基因与GDF9基因在辽宁黑猪、长白、大约克、丹育猪和杜洛克猪种中与控制猪产仔数的主效基因紧密连锁。优势基因型BBDD纯合子比AACC型纯合子母猪平均每胎多产仔1.5头(p<0.01),因此FSHβ亚基基因与GDF9基因的优势等位基因可以用于实践中改良猪的产仔数性状。