经过50年的发展，我国的自然保护区建设取得了巨大的成就。然而，在保护区的管理中存在着许多问题，既有体制因素，也有自身管理问题。本文以上海九段沙湿地国家级自然保护区为研究对象进行分析。 上海九段沙湿地自然保护区成立于2000年3月，由上海市人民政府委托浦东新区人民政府管理，上海市环保局对其业务指导。2005年7月成功晋升为国家级自然保护区。九段沙湿地具有重大的生态价值、经济价值、社会价值和科研价值，对长江三角洲经济带和上海市社会经济发展具有长远而又深刻的影响。本论文将就目前九段沙湿地国家级自然保护区的管理问题进行研究，与国外发达国家进行比较，运用有关公共管理理论进行分析，从而提出对策和建议。 本论文分三章。第一章介绍上海九段沙湿地国家级自然保护区概况，分两个部分分别陈述保护区的自然条件和价值。 第二章论述九段沙湿地国家级自然保护区管理存在的问题及其原因。分四个小节，分析保护区管理目前存在的主要问题：管理体制、权属问题、管理投入和管理水平。管理体制从多头管理和缺乏监督两个角度予以论述；权属问题主要是围绕土地和资源两方面进行分析；管理投入从资金和人员两个方面予以分析；管理水平从管理机构、管理效能和科研三个层次进行阐述。 第三章对策及其理由，以五个小节进行分析论证。第一节建立合理的管理体制。通过目前存在的缺点，与国外进行比较，运用有关管理理论，提出从决策、执行和监督三个方面建立合理高效的管理体制。第二节明确权属。针对目前保护区权属存在的问题，提出明确区域归属和土地使用权及建立新型的保护区管理模式这两个建议。第三节加大管理投入。对拓宽资金来源渠道，用公共物品和外部效应理论论证政府投资为主的必要性和合理性；对加强人才的引进和培养，运用有关人力资源管理理论加以论述。第四节提高管理水平。从完善管理机构、提升管理效能和加强科学研究三个方面，论述如何提升管理水平。第五节制定新的法律法规。阐述国家和地方分别修订《自然保护区条例》和制定《上海九段沙湿地国家级自然保护区管理条例》这两个法律法规。