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地方鸡因其优良的肉蛋品质而深受广大消费者青睐,但由于多数地方鸡品种产蛋性能较差,在很大程度上影响了地方鸡养殖的经济效益。因此,挖掘与产蛋性能相关的关键基因及其分子标记,进而通过遗传选择提高产蛋性能是地方鸡育种的迫切需要。本研究通过对产蛋前期（15周）和产蛋高峰期（30周）卢氏鸡下丘脑转录组测序分析,挖掘出差异表达基因;然后利用Gene Ontology富集分析,筛选参与繁殖调控生物学过程的差异表达基因;进而通过蛋白质互作网络分析,筛选调控繁殖过程的潜在候选基因。在此基础上,利用qRT-PCR对潜在候选基因在两个地方鸡品种（卢氏鸡和固始鸡）产蛋前期和产蛋高峰期下丘脑中表达水平的变化趋势进行分析,进而对基因表达量与30周龄固始鸡产蛋数和血液生殖激素水平进行相关性分析,筛选影响地方鸡产蛋性能的关键基因;从这些关键基因中筛选单核苷酸多态性位点,并与不同时期产蛋数进行关联分析,进一步确定这些关键基因中影响产蛋的潜在SNP位点。最后,利用功能获得与缺失试验在下丘脑神经元细胞中分析关键基因CNR1基因对GnRH表达量及GnRH激素水平的作用。结果如下:1、通过比较产蛋前期和产蛋高峰期卢氏鸡卵巢形态和生殖激素水平发现,产蛋高峰期血清中促卵泡素（FSH）、促黄体素（LH）、雌激素（E2）和孕激素（PROG）的水平均显著高于产蛋前期,而催乳素（PRL）的水平显著低于产蛋前期。分别采集产蛋前期（15周）和产蛋高峰期（30周）卢氏鸡各3个个体的下丘脑组织进行转录组测序,共鉴定出518个差异表达基因;GO富集分析差异表达基因的生物学功能,结果显示这518个基因显著富集在340个GO Term中,包括247个生物学过程,64个细胞成分和29个分子功能。其中,有10个GO Term富集于神经递质水平调节、神经递质转运、神经递质转运调控、激素转运、促卵泡激素分泌、激素水平调节、突触囊泡周期、囊泡介导突触转运、跨突触信号、预测囊泡定位的建立等参与鸡下丘脑繁殖调节的相关生物学过程。对富集到的这10个GO Term中的64个差异表达基因构建蛋白质互作网络,共筛选出16个高连接度（Degree≥12）的基因（APP、SNAP25、SYT1、POMC、TRH、ANXA5、SYNJ1、PENK、NRXN1、TTR、SLC1A2、DNM1、AP2M1、HIP1R、GABRA1、CNR1）,这些基因被认为是参与繁殖调控的潜在候选基因。2、对上述鉴定到的16个潜在候选基因在卢氏鸡和固始鸡产蛋前期（15周）和产蛋高峰期（30周）下丘脑中的表达模式进行分析,结果显示,SYNJ1、SYT1仅在固始鸡产蛋前期和产蛋高峰期下丘脑中差异显著（P＜0.05）,HIP1R仅在卢氏鸡两个时期中差异显著;APP和DNM1在两个地方鸡品种的产蛋前期和产蛋高峰期下丘脑中差异不显著（P＞0.05）,其余11个基因（SNAP25、POMC、TRH、PENK、NRXN1、TTR、SLC1A2、AP2M1、GABRA1、ANXA5和CNR1）在两个地方鸡品种中表达趋势相同,在15周和30周下丘脑中均差异显著（P＜0.05）;对上述11个基因在30周高产和低产固始鸡下丘脑中的表达趋势进行分析,有8个基因（ANXA5、NRXN1、PENK、SLC1A2、SNAP25、TRH、AP2M1、CNR1）在高产和低产固始鸡下丘脑中差异表达（P＜0.05）;进一步对30周高产和低产固始鸡的产蛋数和生殖激素水平进行分析,结果显示,高产固始鸡血清中FSH、LH、E2、PROG的水平均显著高于低产固始鸡,而PRL的水平显著低于低产固始鸡;继而对这8个基因的表达量与30周固始鸡产蛋量、生殖激素水平进行相关性分析,结果显示,CNR1、AP2M1基因的表达量与产蛋量、FSH、LH、E2、PROG呈不同程度负相关、与PRL呈正相关;ANXA5、NRXN1、PENK、SLC1A2、SNAP25、TRH的表达量与产蛋量、FSH、LH、E2、PROG呈不同程度正相关、与PRL呈负相关。在固始鸡群体中对这8个基因的SNP位点进行扫描,共筛选到11个SNP位点,其中8个SNP位点可利用KASP技术进行高通量基因型分析;将这8个位点的不同基因型与产蛋性状进行关联分析,结果显示,这8个SNP位点的不同基因型与不同阶段的产蛋数存在显著相关（P＜0.05）。3、利用qRT-PCR检测CNR1基因在30周固始鸡中的组织表达规律,结果显示,CNR1基因在垂体、下丘脑中表达量高,胸肌中表达量低;构建CNR1基因的过表达载体并合成相应的干扰片段,分析CNR1基因对下丘脑神经元细胞中GnRH的表达量和激素水平的影响,结果表明CNR1基因抑制下丘脑神经元细胞中GnRH的表达和GnRH的合成。综上所述,本研究在产蛋前期和产蛋高峰期卢氏鸡下丘脑转录组中共鉴定出518个差异表达基因,其中有64个基因显著富集在参与下丘脑繁殖调节的生物学过程中;通过构建蛋白质互作网络,进一步筛选出16个参与繁殖调控的潜在候选基因;通过对上述16个基因在15周和30周卢氏鸡和固始鸡下丘脑中的表达分析发现,有11个基因在两个品种间表达趋势相同,在产蛋前期和产蛋高峰期中差异表达;进一步对这11个基因在30周高产和低产固始鸡下丘脑中的表达水平进行分析,鉴定出8个在高产和低产固始鸡下丘脑中显著表达的关键基因;从这8个基因中成功鉴定出8个SNP位点,关联分析显示,这8个关键基因的SNP位点的不同基因型与不同阶段的产蛋量显著相关。在下丘脑神经元细胞中过表达及干扰CNR1基因显示,CNR1基因抑制下丘脑GnRH基因的表达和GnRH激素的合成。这些发现为进一步理解卢氏鸡产蛋性能调控机制提供了新见解,并为地方鸡繁殖性能选育提供了可能的分子标记。