猫免疫缺陷病毒(feline immunodeficiency virus，FIV)是逆转录病毒科慢病毒属成员，该病毒主要破坏猫科动物的免疫系统，导致TCD4+淋巴细胞的衰竭，造成免疫抑制，引起由继发感染和机会感染，主要临床症状表现为口炎、中枢神经疾病、皮肤病、腹泻、肺炎等，严重地导致死亡。FIV感染呈全球性分布，主要经血液、唾液和尿液传播。FIV除了感染流浪猫外，近年来，国外野生动物园不断有狮、虎、豹等野生猫科动物感染FIV的报道，而我国目前关于流浪猫和其它野生猫科动物FIV的感染情况几乎处于空白状态。因此，建立该病的快速诊断方法，开展流行病学调查，采取相应的预防措施和管理办法，对降低FIV对流浪猫、大型猫科动物的危害以及野生猫科动物的管理均具有重要意义。　　本实验收集哈尔滨市和上海市流浪猫全血样本274份，通过ELISA检测得到17只FIV阳性，2只猫白血病(feline leukemia virus，FeLV)阳性，巢式PCR检测FIV11只为阳性，PCR检测FeLV均为阴性。FIV阳性检出率为4％(11/274)，其中上海5只，哈尔滨6只;雄猫8只，雌猫3只。通过巢式PCR扩增gag基因CA片段检测FIV病毒，对FIV env V3-V5进行系统发育分析，确定11个阳性样品均为A亚型。克隆得到一株完整的FIV基因组DNA序列，确定其主要开放阅读框:gag，pol，env，vif对应的大小分别为1350bp，3096bp，2565bp，756bp;对应编码氨基酸个数分别为449aa，1031aa，854aa，251aa;GenBank登录号为MF352016。与PPR(M36968)和Petaluma(NC001482)进行同源性分析，gag为96.64％，95.55％;env为87.70％和93.70％;pol为83.76％和95.59％;vif为91.0％和93.43％。完整核苷酸序列与亚型A的FIVCG(M25381)和Petaluma(NC001482)同源性分别为93.11％和93.16％，亚型C的BM3070(AF474246)为81.22％。与非洲狮分离株1027(EU117992)同源性52.01％。　　综上，本实验共检出11只阳性猫FIV，总检出率4％，构建进化树确定其为A亚型。FIV主要ORF遗传进化分析显示，长期的遗传变异过程中gag和pol基因相对保守，env则显出了巨大的多样性。