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细胞凋亡，又称细胞程序性死亡，是多细胞有机体中广泛存在的生物现象，在机体的发育，免疫应答，清除受损细胞以及维持内环境稳定方面起到了重要的作用。目前有大量的研究阐述细胞凋亡的机制，尤其是在哺乳动物中，然而关于头索动物细胞凋亡方面的研究报道却非常有限。本研究克隆得到了文昌鱼Fas死亡结构域相关蛋白FADD，并对其做了功能分析。
FADD(Fas-associateddeathdomainprotein)，又称MORT1，是死亡信号转导中的一个连接蛋白，参与Fas或某些肿瘤坏死因子受体(tumornecrosisfactorreceptor，TNFR)超家族成员介导的细胞凋亡通路。在脊椎动物中，FADD的结构和功能都很保守，为了探讨低等物种中FADD的特性及其在进化中是否保守，我们采用RACE-PCR和GenomeWalking的方法分别克隆得到白氏文昌鱼BranchiostomabelcheriFADD(bbFADD)的cDNA序列和基因组DNA序列。bbFADDcDNA全长1239bp，编码217个氨基酸。与脊椎动物的FADD一样，bbFADD同样含有2个结构域，即N端的死亡效应结构域(DeathEffectorDomain，DED)和C端的死亡结构域(DeathDomain，DD)。已报道的人类和鼠的FADD的基因编码区都含有两个外显子，但是bbFADD却含有3个外显子，与海胆FADD基因组结构相似。同源性分析显示，bbFADD氨基酸序列的第33位氨基酸苯丙氨酸F33，相当于人类FADD的第25位氨基酸苯丙氨酸F25，在从海胆进化到人的过程中都很保守，此位点的苯丙氨酸对FADD的自我相互作用起到了重要的作用。基于各物种FADD氨基酸序列构建的系统进化树显示，虽然文昌鱼处在无脊椎动物进化到脊椎动物的中间过渡阶段，但是文昌鱼与海胆的亲缘关系更近。bbFADD在HeLa细胞中的超表达能够引起HeLa细胞发生凋亡，证明了我们克隆得到的bbFADD是有生物学功能的，它可能能够参与到人类细胞的凋亡通路中引起细胞发生凋亡，这也从侧面说明了凋亡系统在进化过程中是保守的。