伴随经济一体化和全球化的发展,世界经济的网络化和相互渗透性也不断加强。跨界合作,经济互动是经济运行的新趋势新阶段。在全国范围内,区域一体化也日益加强。淡化行政区划的概念,加强彼此的互动和协调,已是各地区各城市发展的必然要求,在此前提下,大都市区应运而生。针对都市区建设中面临的问题,从政府方面来说,政府作为都市区建设的主体,都市区内各地方政府如何通过协作达到都市区的利益最大化以及人民福祉最优化就具有了研究价值。本文针对目前区域一体化的发展态势,对我国所形成的都市区的现状做了相应的分析。主要以福建省厦漳泉大都市区为例,分析研究了在都市区中的政府协作思路问题。厦漳泉都市区作为目前国内较为较晚起步尚属于探索阶段的都市区之一,同时也是一个跨行政区的都市区,长期以来由于地方政府受利益驱的影响,都市区中政府的协作存在一系列问题,这与都市区内法规不健全,协作机制不完善,缺少监督性执行机构以及相应的利益补偿机制等方面有着密切的关系。为了更好地促进都市区的发展,有必要建立跨都市区行政区的协调管理机构；加强都市区政府政策制度的整合；不断进行改革和创新,鼓励非政府组织的合作,有效发挥第三部门的作用；完善法规制度方面的建设。在充分考虑都市区各组成人员之间利益基础之上,协调和处理好都市圈区中的矛盾,促进都市区中的各城市更好的协调和发展。