人的抗原加工相关转运体（Transporter associated with antigen processing，TAP）是一种异源二聚的ABC转运复合体，负责筛选由蛋白酶体水解生成的内源性抗原肽片段，并跨过内质网膜将其从胞浆中转运至内质网腔中，然后抗原肽得以同MHCI分子结合，继而被呈递至细胞表面，供免疫细胞识别，继而引发免疫反应。伴随人们对于TAP基因的解码以及对TAP分子在免疫应答中所起作用的认知，有关TAP分子同疾病关联也得到了进一步的深入研究。近年来越来越多的研究证实TAP分子与多种慢性感染疾病、自身免疫疾病等密切相关。然而，在当前缺乏高分辨率全长TAP的3D结构解析，TAP分子的结构和功能、抗原肽的转运机制仍不清楚。　　这里，我们基于同源建模方法，使用了Pgp-based-TAP-model2模型，然后利用拉伸分子动力学的方法来模拟抗原转运机制，并获得转运过程中膜蛋白TAP分子和抗原肽相互作用的各个结构。通过分析转运过程体系的构象变化，找出TAP同抗原肽的结合态。利用该结合态结构，我们发现在TAP上一些在与抗原肽结合过程中起到了关键作用的残基。由这些残基及周围的残基构成的一个疏水口袋，该口袋为抗原肽的C端提供了结合锚点，并引导抗原肽与TAP分子结合。同时，通过对比抗原肽在结合前后的构象，我们还发现在结合前后抗原肽的结构发生了明显的变化，这意味着抗原肽可能以一种扭曲的状态同TAP分子结合，这和其他的一些研究结果一致。