当前各种特殊类疾病已经成为阻碍我国公民身心健康,影响社会和谐稳定的重大现实和热点问题。在过去,由于指导思想的不明确性,无论是在医疗体制改革方面,还是医疗机构档案管理研究方面,公益性特种医疗机构都是容易被忽视的一个存在领域。公益性特种医疗机构作为医疗机构中具有特殊社会性意义的医疗事业机构,在医院档案管理方面,不能完全照搬照抄一些正常医疗机构档案的管理模式,完全的照搬照抄会在一定程度上降低特种医疗机构的服务性。要想对公益性特种医疗机构档案加强管理,使公益性特种医疗机构档案得到充分的利用,就很有必要深入探析公益性特种医疗机构档案不同于正常医疗机构档案的特殊之处,进而了解公益性特种医疗机构档案管理都有哪些特点。首先笔者对公益性特种医疗机构进行了概念界定,阐述了这类医疗机构的特殊之处,紧接着又介绍了何为公益性特种医疗机构档案,其中主要介绍了这类机构的档案在来源、形式、内容以及利用上都与正常的医疗机构档案存在哪些差异,通过这一系列的分析与阐述,归纳总结出公益性特种医疗机构档案在管理方面的独有特点,并针对这类机构档案管理的特点提出几点建设性建议,一方面使特种医疗机构档案得到更加充分的利用,另一方面还为特种医疗机构的健康发展和医院文明建设提供良好的准备条件。