随着市场经济的不断完善,我国科研院所要取得跨越式发展,就必须要提升自己的管理水平,尤其是财务管理的水平。随着信息时代的到来,计算机技术日新月异,应用范围越来越广,科研院所会计信息化要面对的整个环境发生了巨大的改变。基于此新背景,如何将信息技术与对会计职能的新要求结合在一起,在减少成本同时还能提升财务管理的效率;如何全面、快速、精准地为科研院所管理者提供科学、有效及时的信息;如何建立一个科研院所会计信息化的新流程,以此来满足新形式下对会计职能的要求。上述这些问题都是建立科研院所会计信息化新模式所亟待解决的问题,也是本文研究的主要内容。本文受到企业资源计划、流程再造、业财一体化等经典理论的启发,在参考了当前先进管理软件在企业的成功应用的基础上,结合A研究所的实际情况,提炼出A研究所当前关于会计信息系统业务流程与数据流程存在的问题,并对A研究所的会计信息系统进行如下优化:一是建立了基于业务事件的系统处理流程;二是使系统能集成业务事项的数据;三是使系统能实施信息的实时处理。在此基础上提出了基于业财一体化的会计信息系统整体框架,使业务事项数据高度集成与共享,减少数据的重复采集,优化会计账务处理流程,促进业财融合。最后,本文结合案例,为A研究所设计与开发了一套基于业财一体化的会计信息系统。通过系统的顺利运行,本文将理论结合实践,为提升A研究所的管理水平提供了帮助。