【摘 要】
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KRAS突变常见于胰腺癌和肺癌患者中,并且和患者的预后、免疫反应或免疫治疗相关。为了研究KRAS突变对肿瘤免疫微环境的影响并构建KRAS突变相关基因的预后模型,我们下载了TCGA和GEO数据库中胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)和肺腺癌患者的基因数据和临床资料。以此为基础分析了KRAS突变和野生型患者基因表达的差异,并对差异基因进行单因素Co
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KRAS突变常见于胰腺癌和肺癌患者中,并且和患者的预后、免疫反应或免疫治疗相关。为了研究KRAS突变对肿瘤免疫微环境的影响并构建KRAS突变相关基因的预后模型,我们下载了TCGA和GEO数据库中胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)和肺腺癌患者的基因数据和临床资料。以此为基础分析了KRAS突变和野生型患者基因表达的差异,并对差异基因进行单因素Cox分析,根据筛选出的预后相关的差异基因通过LASSO惩罚Cox回归构建了预后模型,并详细分析了预后模型对肿瘤免疫微环境和免疫治疗的影响。在PDAC中,研究发现有25个与预后相关的差异免疫基因,并构建了一个包含5个基因的免疫预后模型。该模型能够有效地在TCGA训练集和GEO验证集中将PDAC患者按预后状况划分为高风险和低风险组。多因素Cox回归分析发现风险评分是PDAC患者的独立预后因素。此外,相比高风险组,低风险组患者拥有更多肿瘤浸润的CD4+T细胞、嗜中性粒细胞、巨噬细胞和树突细胞,及更多免疫检查点分子PD1、CTLA4、TIM3、TIGIT和LAG3的表达。最后基于风险评分、肿瘤大小、肿瘤位置和是否接受化疗构建了一个列线图来更好地预测1、2和3年PDAC患者的生存率。在肺腺癌中,研究发现有220个KRAS突变相关的差异基因,并构建了一个包含12个基因的预后模型。该模型能够有效地在TCGA训练集和GEO验证集中按预后状况将肺腺癌患者划分为高风险和低风险组。多因素Cox回归分析发现风险评分是肺腺癌患者的独立预后因素。此外,相比高风险组,低风险组患者拥有更多肿瘤浸润的B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞和树突细胞,并更可能从免疫治疗中获益,但对化疗药物的敏感性较低。最后基于风险评分、肿瘤分期、肿瘤T分期和肿瘤N分期构建了一个列线图来更好地预测1、3和5年肺腺癌患者的生存率。本研究为PDAC和肺腺癌的免疫微环境和癌症治疗提供了新的见解。构建的模型能够将PDAC和肺腺癌患者分为具有不同预后和免疫表型的亚组,具有潜在的临床应用价值,为将来实施个性化医疗和改善患者预后提供参考。
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