我国新时期的高等教育规划要求各高校立足人才培养,以人才输出和服务地方经济为目标,在突出办学特色的同时不断进行高校内部管理体系改进,优化内部资源配置,全面提升高校整体办学质量。因此,全国高校不断进行改革和创新,旨在建立健全更加完善的高校服务体系,提高人才输出与服务质量。在摸索创新的过程中,越来越多的高校开始实行“权力下放、以学院为基础的二级单位管理”制度,即高校将管理权限和财政权力下放到各个学院,由学院根据所需自行管理和安排,提高效率。这客观上要求各学院承担管理责任,履行分配义务,将资源优化配置,同时利用所拥有的资源创造更高的价值。但是,目前大部分高校在实行该制度的过程中依旧存在诸多问题,尚未建立完善的绩效评价体系、绩效评价指标选择不合理、绩效评价过程简单草率等问题屡见不鲜,这些现象往往会造成绩效评价体系不能真正反映高校运行的实际情况,绩效评价流于形式的后果,影响高校的整体发展以及高校战略目标的实现。基于上述背景,本文运用关键绩效指标法,以利润中心理论为原则,构建绩效评价指标体系,即构建以人力资源投入、物力资源投入以及财力资源投入为核心的投入评价指标和以人才培养产出、科学研究产出、社会服务产出为核心的产出评价指标。本文首先对国内外研究现状进行梳理总结,并对绩效、绩效评价、二级单位等理论内容进行阐述,明确文章的理论基础;然后以C地方大学二级单位为案例,选取关键绩效指标,结合具体数据构建二级单位绩效评价体系并进行分析评价;最后对C地方大学二级单位的绩效评价结果进行分析研究并提出未来完善措施。