基于生物信息学的IgA肾病基因富集及免疫细胞浸润分析

来源 :中华肾病研究电子杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chaosum

【摘要】

：

目的基于生物信息学对IgA肾病(IgAN)基因表达谱数据进行基因富集分析和免疫细胞浸润分析,旨在研究IgAN相关免疫机制。方法从基因表达集(GEO)数据库获取IgAN肾脏组织的GSE93798整体RNA序列数据,利用limma软件包筛选正常对照与IgAN的差异表达基因;利用ggplot2软件包进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库进行通路富集分析;利用CIBERSORT软件获得免疫细胞浸润矩阵;从GEO数据库获取IgAN肾脏组织的GSE127136单细胞RNA序列数据;利用主成

【作者】

：

金美玲李艳春王佳张敏李新赵素梅徐晨

【机构】

：

首都医科大学附属北京朝阳医院肾内科

【出处】

：

中华肾病研究电子杂志

【发表日期】

：

2021年4期

【关键词】

：

IGA肾病基因富集分析免疫浸润

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81900605,81901404),北京市自然科学基金(7204308),河北省重点研发计划项目(18277746D)。

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