上海交通大学附属第六人民医院建于1904年。该院是“中国超声诊断发源地”，也是我国断肢再植的“摇篮”。医院目前共有33个临床科室，9个医技科室。同时，医院还设有上海交通大学市六临床医学院，上海市四肢显微外科研究所，上海市糖尿病研究所、上海交通史学影像医学研究所、上海交通大学耳鼻咽喉研究所，上海交通大学创伤骨科研究所和上海交通大学糖尿病研究所。
　　
　　重点学科
　　
　　国家级：骨外科学、内分泌与代谢病学、心血管病学
　　市级：四肢显微外科，内分泌代谢科，介入影像学和遗传学
　　上海市临床医学中心：创伤骨科临床医学中心，糖尿病临床医学中心
　　
　　特色科室
　　
　　骨科
　　该科现已发展成以四肢显微外科为主要特色的综合性创伤骨科。下辖修复重建外科、创伤外科、矫形外科、关节镜外科、关节外科和脊柱外科共6个专业8个亚学科。在肢体再植、再造和修复，骨折诊治，微创人工关节置换，骨科导航手术等方面具有丰富经验。
　　
　　内分泌代谢科
　　该科以糖尿病诊治见长，设有糖尿病足、肥胖及代谢综合征、妊娠糖尿病、糖尿病遗传咨询、糖尿病肾病，糖尿病视网膜病变等多个亚学科门诊。该科在糖尿病病因诊断、发病机制、糖尿病代谢控制及慢性并发症的早期诊治方面具有丰富经验。
　　
　　心内科
　　该科是国内最早开展心血管疾病介入诊断、治疗的专业科室之一，在冠心病、先天性心脏病、肥厚梗阻性心肌病、瓣膜病、大血管及外周血管的介入治疗’各类快速心律失常的射频治疗各种形式的起搏器治疗等方面，具有丰富经验。
　　
　　放射科
　　该科为上海市医学重点学科，上海交通大学影像医学研究所和神经介入中心之挂靠单位，我国放射诊断学奠基人之一邹仲教授是学科的首任主任。该科以脑血管疾病微创(神经介入)／无创(MRA)诊治，脊柱病变诊治、骨关节影像诊断为特色。
　　
　　超声医学科
　　该科最具特色的项目包括：腹部、泌尿系统超声诊断，肿瘤(肾、前列腺癌、肝等)的射频消融治疗，甲状腺结节超声引导下微创治疗，以及血管和运动医学的超声诊断。
　　
　　特色医疗
　　
　　多学科联合诊治胃肠道肿瘤
　　该院的胃肠肿瘤多学科联合诊治协作组联合胃肠外科、消化内科、内镜中心、肿瘤内科、营养研究室等部门，为胃肠道肿瘤患者提供早期诊断，规范化手术、术前术后放化疗及围手术期营养支持、术后随访等全方位诊疗服务。此外，该协作组还开发了多种新技术用于胃肠肿瘤的诊治，如腹腔镜治疗中低位直肠癌、内镜腹腔镜联合治疗大肠息肉等。
　　
　　导航技术：让骨科手术更微创
　　骨科导航技术如今已被该院用于脊柱外科，关节外科、创伤外科、骨肿瘤和矫形外科等多个领域。以骨盆骨折为例，由于骨盆的解剖结构特殊和邻近器官解剖关系的复杂，传统手术存在时间长、出血量大等不足。导航技术可以帮助医生做到多角度、实时监控操作，最大限度地避开危险区域，不但切口小、创伤小，而且手术时间短、出血少。对多发骨折患者而言，导航技术的优点在于无需过多改变手术体位，并能准确指出内固定物放置的位置，大大降低手术风险。
　　
　　糖尿病视网膜病变的综合治疗
　　该院眼科与内分泌代谢科于2002年联合成立了“糖网病临床诊治中心”，配备了国际先进的诊疗设备，包括蔡氏眼底成像系统、眼底激光、视野计、眼部超声等，为广大糖尿病视网膜病变患者提供全套诊疗服务。近年来，该院眼科在眼后段疾病诊疗方面积累了丰富经验。诊疗范围包括：糖尿病视网膜病变、黄斑变性、各种原因引起的眼底出血、视网膜血管阻塞、高度近视眼底病变、眼底肿瘤、视神经病变、葡萄膜炎等。