目的探讨重复经颅磁刺激（rTMS）对认知功能障碍患者灰白质区域微结构的影响。方法随机选取2017年5月-2019年5月在河北省三河市燕郊人民医院神经外科治疗的认知功能障碍患者90例,按照患者治疗方法不同分为观察组50例和对照组40例。观察组使用高频rTMS刺激患者右侧背外侧前额叶10 d,采用刺激频率为10 Hz;对照组采用伪刺激,刺激频率为10 Hz,时间为10 d。分析重复经颅磁刺激前后两组间的简易智力状态检查表（MMSE）评分、蒙特利尔认知评估量表（MoCA）评分差异,及弥散各向异性分数（FA）的差异。研究两组在重复经颅磁刺激治疗前后MMSE评分、MoCA评分改变量和FA改变量的相关性。结果重复经颅磁刺激治疗后,两组患者MoCA评分及MMSE评分均显著高于本组治疗前评分,差异有统计学意义（P<0.05）;治疗后观察组MoCA评分及MMSE评分均高于对照组,差异有统计学意义（P<0.05）。治疗后观察组右侧额中回、右侧枕叶、右侧顶叶、双侧额上回及双侧楔前叶的FA值较对照组增加,而左侧丘脑、左侧海马、左侧颞中回及左侧舌回FA值显著降低。观察组患者治疗后的MMSE评分和左侧海马改变量呈显著负相关（r=-0.521,P=0.029）,与左侧枕叶的改变量呈显著负相关（r=-0.598,P=0.007）,观察组患者治疗前后MoCA评分与左侧枕叶改变量呈显著负相关（r=-0.497,P=0.031）。结论重复经颅磁刺激对认知功能障碍患者的认知功能有一定的改善,可改变认知功能障碍患者灰白质区域微结构参数。