【摘 要】
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目的 通过分析16S rRNA在不同分枝杆菌中的异同，探讨测序技术有关的实验和数据处理问题。方法 采用Mega6.0软件对34株非结核分枝杆菌分离株及美国国家生物技术信息中心（NCBI）现有的55株常见致病分枝杆菌和1株诺卡菌的16S rRNA序列进行比对分析，并用Maximum Likelihood法构建进化树，最后用DNASTAR/MegAlign程序计算种间及种内相似性。结果 PCR扩增后获
【基金项目】
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上海市公共卫生体系建设三年行动计划（2020-2022年）（GWV-10.1-XK04）；
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目的 通过分析16S rRNA在不同分枝杆菌中的异同，探讨测序技术有关的实验和数据处理问题。方法 采用Mega6.0软件对34株非结核分枝杆菌分离株及美国国家生物技术信息中心（NCBI）现有的55株常见致病分枝杆菌和1株诺卡菌的16S rRNA序列进行比对分析，并用Maximum Likelihood法构建进化树，最后用DNASTAR/MegAlign程序计算种间及种内相似性。结果 PCR扩增后获得长度约为1 500 bp的目的片段，与下载获得的16S rRNA序列进行比对分析并剪齐后保留1 248 bp, 16S rRNA可以将常见致病性分枝杆菌分为18群，种间相似性为91.5%～100.0%,种内相似性为99.0%～100.0%。结论 16S rRNA种内保守性高且具有较好的种特异性，除了龟分枝杆菌和脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌、溃疡分枝杆菌和海鱼分枝杆菌、人型分枝杆菌和牛型分枝杆菌不能分开外，16S rRNA可将常见致病性分枝杆菌各种分开，可作为一种较好的鉴定分枝杆菌的方法。
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