白菜bZIP转录因子基因家族应答春化反应关键基因表达分析

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为研究白菜(Brassica rapa)碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper, bZIP)转录因子家族基因(BrbZIP)的相关功能,通过生物信息学分析技术,鉴定全基因组的BrbZIP基因家族成员,并对其染色体分布、进化关系、表达模式及其应答春化反应等进行了分析。白菜bZIP转录因子基因家族共有118个成员,在染色体上不均等分布。白菜组织转录组分析结果显示,大部分BrbZIP基因在根、茎、叶、花及荚中均有较高的表达丰度,且具有组织表达特异性;春化反应转录组、荧光定量PCR及相关基因互作网络分析结果表明,白菜bZIP基因家族中应答春化反应相关基因上调与下调表达基因数量差异不大,相互之间存在复杂的互作网络,其中4个成员(Bra039631、Bra020620、Bra004550与Bra020471)是应答春化反应的中心节点。
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