CPU-MIC异构并行架构下基于大规模频繁子图挖掘的药物发现算法

来源 :大数据 | 被引量 : 0次 | 上传用户:khalista9
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
频繁子图挖掘是许多实际应用领域中需要解决的重要问题,由于计算密集性、挖掘的图集及其结果容量大,现有的频繁子图挖掘方案无法满足时间需求,其处理效率是目前面临的主要挑战。原创性地提出了并行加速的频繁子图挖掘工具cmFSM。cmFSM主要在3个层次上进行并行优化:单节点上的细粒度OpenMP并行化、多节点多进程并行化和CPU-MIC协作并行化。在单节点上cmFSM的处理速度比基于CPU的最佳算法快一倍,在多节点方案中cmFSM提供可扩展性。结果表明,即使只使用一些并行计算资源,cmFSM也明显优于现有的最先进的
其他文献
英语中介词With的用法很复杂。但在学习中,单纯地研究它本身的用法,而不去研究它与其他介词在使用时的区别,就难以达到运用自如的程度了。 本文着重对With与常用的几个介词的
随着集成电路产业的高速发展,半导体器件的特征尺寸缩小到亚20nm节点,芯片集成度的提高带来了更大的功耗密度。与此同时,为了抑制由器件尺寸缩小而带来的短沟道效应,新型器件结构(如非平面三维FinFET器件、绝缘衬底上薄膜硅SOI结构器件以及环栅硅纳米线结构器件等)和新的材料(如低热导率的SiGe和高k栅介质层等)被引入到传统的硅基MOS器件当中,这些先进技术虽然为摩尔定律的延续创造了可能,但是其低效
在世界能源紧缺和环境污染不断加剧的背景下,污水厌氧生物处理技术经济可行,该技术能适应社会和环境的可持续发展要求,势必成为21世纪污水处理领域的核心技术.本文回顾了污水
随着生态园林城市建设逐步加快,对林业绿化中树木移植有了更高的质量要求。为了提升树木移植的成活率,必须要提高移植栽培的技术水平,提升其移植质量。本文主要讨论林业绿化
为开发低致敏性蛋清制品,用不同的蛋白水解酶和非蛋白氧化酶及常规加热法处理蛋清。结合酶联免疫技术评价测定,发现在适宜条件下用菠萝蛋白酶处理,蛋清致敏性降低约79.63%,葡
国有企业的设立目的与反垄断法的立法价值之间存在一定程度的冲突。这使得各国在处理反垄断法与国有企业关系方面存在两种不同的立场,导致各国反垄断法在适用于国有企业方面存
皖北“十二五”发展成效显著,但在经济新常态下,皖北经济人均水平低的“经济洼地”特征更加突显,外在因素是产能过剩、增速换挡、结构转换与能源资源价格下跌,内在机理是创新发展
集中研究了非结构化的数据存储和查询。为了在保证查询成功率的同时最小化总的能耗,分别在存储受限和不受限两种情况下,建立了MESQ(minimizing energy on successful query)优化
目的探讨Russell-Silver综合征(RSS)发病机制。方法采集6例男性,年龄6~8岁的临床表型疑似RSS患儿,以及2例患儿父母、5例健康男性儿童的外周血2mL,分离单个核细胞并提取基因组
本研究综述在专利中海藻用作肥料的处理技术,包括发酵工艺、化学提取工艺、酶解工艺、炭化工艺及包膜工艺,为海藻肥料的进一步发展提供理论基础,从而促进农业生产的环保、高