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目的:了解云南省医疗机构药品短缺现状及短缺原因,为解决药品短缺问题提供参考。方法:采用问卷调查方法,对云南省61家医疗机构(三级医院19家、二级医院26家、一级医院16家)的药品短缺情况进行调查,运用SPSS 19.0软件,以描述统计方法对不同级别医院的数据进行分层汇总分析。结果:共发放61份问卷,回收57份有效问卷,有效回收率为93.44%。从药品短缺情况来看,急救药品短缺品规整体构成比在三级医院为22.73%,高于二级医院和一级医院;《国家基本药物目录》、云南省医保药品目录药品短缺品规整体构成比在一级医院均为97.58%,高于三级医院和二级医院;短缺药品类别方面,抗感染药物短缺构成比在各级医院都排在了前2位,中成药制剂短缺构成比在二级医院和一级医院均排第1位。发生药品短缺的原因与药品生产企业、流通企业和医疗机构均有关系,在三级医院与二级医院主要表现为配送公司缺货,在一级医院主要表现为招标平台无药供应与价格倒挂。结论:云南省药品短缺形势依然严峻,造成药品短缺的原因与药品生产、流通、使用环节都有关联。我国当前亟需建立一种药品短缺预防及处理的长效机制,有效预防和解决药品短缺问题,确保患者能够持续获得安全和有效的药品。