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Prony算法可有效进行电力系统低频振荡分析,但是其存在抗噪性弱的缺点。为降低PMU数据中噪声对低频振荡分析辨识精度的影响,本文提出了一种用于Prony算法的数字滤波器设计方案及幅相补偿方法:首先仿照周期信号滤波要求设计了模拟滤波器,针对模拟滤波器造成的Prony算法辨识的偏移,提出幅值及相位补偿方法;然后基于脉冲响应不变法将模拟滤波器离散化为数字滤波器;最后通过滤波后的含噪信号与理想信号对比,验证了该方法的抗噪性能。将该滤波器用于PMU数据进行算例仿真,得到了较好的辨识效果。