【摘 要】
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本研究以‘赤霞珠’葡萄幼叶为试材,构建环状RNA测序文库并鉴定了1172个环状RNA。结果表明,这些环状RNA的来源基因涉及多种功能,包括抗逆、抗病、发育等,并且这些环状RNA中有
【机 构】
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山东省葡萄研究院/农业部华东都市农业重点实验室;
【基金项目】
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山东省农业重大应用技术创新项目-山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用;山东省农业重大应用技术创新项目-特色酒用葡萄产期精准调控与产品创新研究应用;山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2016D01,CXGC2018E17);山东省农业科学院农业科技创新工程-2018年国家自然科学基金培育项目-葡萄及山葡萄冷胁迫响应microRNA的鉴定和功能
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本研究以‘赤霞珠’葡萄幼叶为试材,构建环状RNA测序文库并鉴定了1172个环状RNA。结果表明,这些环状RNA的来源基因涉及多种功能,包括抗逆、抗病、发育等,并且这些环状RNA中有74个可以结合73种葡萄miRNA,而大部分不能结合miRNA。这73种可以结合环状RNA的葡萄miRNA共靶向710个靶基因。很多涉及的miRNA都对应了个10以上靶基因。比较了靶基因和环状RNA来源基因,发现有很多功能类似,但是也有很多不同的功能。GO分析显示二者最富集的条目都是细胞、细胞部分、细胞器、催化活性及绑定。但是二者被注释的条目种类差别很大。说明葡萄环状RNA来源于不同种类的基因,且可能调控多种基因。
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