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目的:分析在新生儿肺炎患儿的治疗中通过合用阿莫西林克拉维酸钾与头孢他啶的治疗有效性及安全性.方法:抽取2019年1月～2020年1月本院80例新生儿肺炎病例,并依据药物治疗差异分组,对照组应用药物头孢他啶治疗,同期观察组加用阿莫西林克拉维酸钾进行治疗.结果:观察组总有效率97.50％,对照组82.50％,且P0.05;治疗后观察组的消化链球菌、肠杆菌数量均低于对照组,双歧杆菌数量高于对照组且P<0.05.结论:新生儿肺炎患儿以阿莫西林克拉维酸钾与头孢他啶进行联合治疗可显著提升疗效,而且对于患儿肠道菌群产生的影响相对较小,具有较高的用药安全性.