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当前海关理论研究已经成为我国海关推进依法行政、提高自身话语权的关键，但也存在着体制机制不畅、效能低下、研究环境支撵不足的突出问题，而仅有一般的共识和理念，已经难以推动海关理论研究向纵深方面发展，难以改变海关在国家宏观经济决策中话语权不断弱化的趋势，难以改变海关在解决自身发展过程中重大难题能力不足的现状，难以改变海关在国际海关界转型发展中地位不符的局面，从而有必要参照府际关系与府际管理，构建科学合理的海关理论研究体制与机制，并充分发挥上海海关学院在其中的优势作用。