【摘 要】
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肠道微生物能够调节动物机体的物质与能量代谢,参与免疫和疾病预防,对于维持动物的正常生理活动至关重要.本研究基于16S rRNA高通量测序,对患肠炎病和健康群组鸳鸯(Aix galericulata)的肠道微生物进行对比,尝试揭示鸳鸯肠炎可能的致病菌.鸳鸯肠道微生物共鉴定出2020个相似度97％的操作分类单元(OTU).健康组和肠炎组共同的OTU数量为564个.健康组鸳鸯的微生物Alpha多样性指数与肠炎组之间无显著差异(Mann Whitney U test,P＞0.05).在门水平,鸳鸯的肠道微生物组成
【机 构】
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上海农林职业技术学院 上海201699;上海动物园 上海200335
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肠道微生物能够调节动物机体的物质与能量代谢,参与免疫和疾病预防,对于维持动物的正常生理活动至关重要.本研究基于16S rRNA高通量测序,对患肠炎病和健康群组鸳鸯(Aix galericulata)的肠道微生物进行对比,尝试揭示鸳鸯肠炎可能的致病菌.鸳鸯肠道微生物共鉴定出2020个相似度97％的操作分类单元(OTU).健康组和肠炎组共同的OTU数量为564个.健康组鸳鸯的微生物Alpha多样性指数与肠炎组之间无显著差异(Mann Whitney U test,P＞0.05).在门水平,鸳鸯的肠道微生物组成以厚壁菌门(Firmicutes)(73.46％)、拟杆菌门(Bacteroidetes) (11.15％)和变形菌门(Proteobacteria)(8.72％)为主.在属水平,丰度最高的类别主要包括狭义梭菌属(Clostridium sensu strict01)(29.65％)、库特氏菌属(Kurthia) (24.74％)和乳杆菌属(Lactobacillus)(12.40％).健康组和肠炎组鸳鸯肠道微生物组成存在显著差异(Adonis,F=3.6087,P＜0.05).在肠炎组中共筛选出25个相对丰度显著高于健康组的类别,其中,狭义梭菌属、埃希氏志贺菌属(Escherichia-Shigella)和脱硫菌属(Desulfovibrio)的相对丰度最高(线性判别分析LDA值＞5,P＜0.05),这3个属的致病菌可能造成肠道微生物群落失衡,机体免疫力下降,是诱发鸳鸯肠炎的重要因素.
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