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编者按：陈云林，1941年12月生，辽宁黑山人。1966年9月参加工作，北京农业大学土壤化学系农药专业毕业。1994年起，先后任中共中央台湾工作办公室、国务院台湾事务办公室常务副主任，主任。中共十四届中央候补委员，十五届，十六届中央委员。2008年6月当选海峡两岸关系协会会长，同时，卸任中共中央台办，国务院台办主任职务。2008年11月，陈云林率海协会协商代表团访问台北，成为首位应邀访台的大陆处理两岸事务受权团体的最高领导人。
2009年4月26日，古城南京，暮春的中山北麓显得尤为葱郁。下午15时，在紫金山庄紫金厅，满面笑容的海协会会长陈云林同台湾海基会董事长江丙坤一起走向签字台，在众多记者的见证下，在协议文本上郑重地签下了自己的名字。刹那间，掌声响起……这是第三次“陈江会谈”最令人期待的一幕。
自2008年5月以来，两岸关系实现历史性转折，两岸受权团体海协会与台湾海基会三度举行会谈，成功签署了九项协议并达成一项共识。
在这硕果累累的背后，我们与本文主人公一起回忆、评点过去和正在发生的两岸故事。
初任国台办主任
1941年12月，陈云林出生于沦陷的东北。思归心切和家园眷恋是陈云林与生俱来的情结。台湾和东北都曾有过被日本军国主义统治的惨痛经历，因此在小学期间学唱台湾岛歌曲时，陈云林就对台湾有一种特殊的感情。说起为什么能够做对台工作，他感慨地说：“这也许是一种缘分吧。”
1966年，毕业于北京农业大学土壤化学系的陈云林被分配到黑龙江省的一家化工企业。后来，他一步步从工人当上了厂长。不久，他被调任齐齐哈尔市任常委、计委主任，1983年被选为市长。1984年末，他被调任黑龙江省任副书记、常务副省长。
1992年邓小平同志发表重要的南巡讲话，1993年4月两岸举行“汪辜会谈”，大陆掀起新一波改革高潮，台商赴大陆投资也出现了井喷式增长。由于对台经济工作事情很多，任务繁重，中央考虑选择一个资历、经验合适的人协助时任台办主任王兆国分管对台经济和日常工作。就这样，1994年初春，陈云林从黑龙江省常务副省长的位置上被调到中共中央台湾工作办公室、国务院台湾事务办公室工作，担任常务副主任。1996年11月，陈云林接任主任，一干就是15年。
这次调任是陈云林人生的一次重大转折。那年他53岁，正值“五十而知天命”的年纪。尽管对于那片他曾工作奋斗近30载的黑土地饱含眷恋，但在致力于国家统一这份神圣责任面前，他更愿意迎接新的挑战。为了更好地贯彻邓小平同志关于对台经济工作的战略构想，刚刚就任新的职务不久，陈云林按照中央的指示精神，全力投入“全国对台经济工作会议”的筹备工作，同相关部委共同研拟出台了一系列对台经济工作的重要决策。由于会议再次明确了对台商投资采取“同等优先、适度放宽”的政策，因此在继续吸引台湾劳动密集型企业的同时，大陆方面充分利用台湾岛内产业转型，极大地推动了台湾技术密集型产业和前500强的大企业前来投资。之后，台办会同商务部认真贯彻全国人大常委会通过的“台商投资保护法”和“实施细则”，鼓励和保护台商投资的正当权益，成功地挫败了李登辉为遏制投资大陆热而制定的“南向政策”、“戒急用忍”政策。两岸经贸交往不断扩大，成为两岸关系中最活跃的因素。在这期间，陈云林还与台湾工商界的重要人士初步建立了相互信任的良好关系。从上世纪90年代初直到今天，由于中央实施的正确的方针政策，对台经济合作规模从小到大，领域不断扩大、层次不断提高，形成了互利双赢的新局面。
几乎是同一时间，两岸关系政治层面的问题也越来越多，呈现出错综复杂的新形势。国际上，冷战结束后，美国为首的西方国家提升与台湾的实质关系，向台出售先进武器，加紧“以台制华”。在岛内，李登辉在集党、政、军大权于一身后，便逐步暴露出分裂国家的“台独”真面目。两岸双方斗争的焦点集中体现在坚持还是背离“一个中国”原则的问题上。特别是2000年陈水扁上台以后，不断推动“台湾法理独立”活动，严重威胁着中国主权和领土完整，以及和平统一的前景、台海局势的和平稳定。
从1995年至2002年的七年时间里，针对李登辉访美制造“两个中国”、公开抛出“两国论”以及陈水扁鼓吹“一边一国论”，党中央领导全国人民，并团结海内外华人华侨，同“台独”分裂势力进行了三场针锋相对的斗争，直接打击了“台独”分裂势力的气焰。
作为这个时期的台办主任，陈云林担子相当沉重。中央台办、国务院台办担负起阻击“台独”分裂势力及其活动的艰巨任务，汇聚各方面力量，坚定地、毫不妥协地同“台独”势力进行坚决的斗争，并取得了一次又一次的胜利。
促成连战、宋楚瑜来访
2005年春夏，中共中央和胡锦涛总书记高瞻远瞩，决定邀请中国国民党主席连战和亲民党主席宋楚瑜来大陆访问，就两党结束过去、面向未来、为中华民族的伟大复兴共同努力交换意见。胡总书记的邀请是通过陈云林接受新华社记者采访的方式发出的。4月1日，连战主席对此正式表示感谢和欣然接受。4月26日，陈云林受中央委托，赶赴南京禄口机场迎接连战一行。那一天艳阳高照，万里无云，连先生出现在飞机舱口的那一刻，全世界的目光在这里聚焦，海峡两岸同胞、海内外华侨、华人以无比兴奋的心情，目睹了连战先生代表的中国国民党跨出的穿越60年历史风云的重要一步。5月5日，陈云林又赴西安机场迎接亲民党主席宋楚瑜一行。事非经过不知难，为了这一刻，陈云林和他的同事们曾经历过无数紧张、充满波折的日日夜夜，终于以善意和诚意，换得了双方的行动。为了这一刻，连战先生、宋楚瑜先生克服种种干扰，展现了对中华民族负责的坚定信念和超人勇气。
4月29日下午和5月12日下午，胡锦涛总书记在北京人民大会堂福建厅先后与连战、宋楚瑜举行正式会谈，发表新闻公报和会谈公报，双方确立了反“台独”、坚持“九二共识”两大共同政治基础，并从政治、经济、文化、军事、对外关系等方面向两岸同胞揭示了和平发展、互利双赢的前景。他们求同存异，为遏制“台独”、维护两岸同胞利益、推动两岸关系向着和平稳定的方向发展所举行的“历史性握手”，奏响了两岸关系以和平发展为主题的新时代序曲。
在此期间，在中央有关部门授权下，陈云林宣布了给予台湾农产品零关税待遇、赠送台湾同胞一对大熊猫、对在大陆高校就读的台湾学生按照大陆学生标准同等收费等惠台政策。在台办主任任上，陈云林推动出台了63项有利于扩大两岸交流、增进两岸同胞利益的政策措施。这些措施，都是在广泛听取 台湾各界人士的建设性意见后适时推出的，用行动向台湾民众展现了祖国大陆改善和发展两岸关系的诚意。
在接待连、宋来访的过程中，有许多鲜为人知的感人细节：在有关方面的大力支持下，台办找到了连战的祖父连横恢复中国国籍的户籍薄和宋楚瑜家族的族谱，协助连、宋二人寻找、修缮先人故迹、家族墓地，这一切使他们深受感动。
大陆同胞自发的热情的欢迎场面贯穿了连、宋来访的每场公开活动。连战拜谒中山陵时，现场早已聚集了大批自发前来的南京市民。连战抵达后，现场掌声雷动，中山陵392级台阶两旁都站满了人，场面壮观。本来十分钟就可以走完的路，足足用了半个多小时。在参观夫子庙、夜游秦淮河时，连战沿途受到南京民众的夹道欢迎。一些台湾记者不相信群众都是自发来的，就钻入人群到处询问，最后他们感慨地说：“这样的同胞情谊和感人场面，我们在台湾已经很多年没有见到了。”宋楚瑜是个爱动感情的人，一路上在热烈的氛围下控制着自己的情绪，当他回到湘潭老家祭祖时看到田头、房顶上那么多陌生而又亲切的面孔时，再也忍不住眼中的泪水。
连战和宋楚瑜的出身、经历、性格虽然有着明显不同，但是他们都是台湾岛内在两岸关系上深具前瞻眼光、充满政治勇气的政党领袖，都有深厚的民族情怀和对两岸关系和平发展历史潮流的深刻把握。他们来访后，国共两党构建了交流平台。迄今为止，两岸领导人已举行了三次会晤，举办了五届两岸经贸文化论坛，两党基层组织全方位开展了对口交流。这些成果，有效地遏制了“台独”活动，为日后两岸关系的转折奠定了坚实的基础。
迎接雨过天晴
面对刚刚出现的两岸关系和平稳定的发展势头，陷入困境的陈水扁决定推进激进的“台独”路线，进行孤注一掷的反扑。2006年2月，陈水扁悍然宣布终止“国统会”运作和“国统纲领”适用。10月，授意抛出所谓“中华民国第二共和宪法草案”。2007年6月，公然推动举办“以台湾名义加入联合国”的公民投票。台海局势再次陷入紧张对抗、千钧一发的危险边缘。为遏制陈水扁一波又一波“台独”冒险，中央针对台湾局势的复杂变化，相继提出坚决制止陈水扁当局通过“宪改”谋求台湾“法理独立”、全力挫败“入联公投”、通过遏制“台独”和维护台海局势稳定，为泛蓝政党赢得选举创造有利条件等四项任务。
有三个特点显示出这是一场环环相扣、惊心动魄、前所未有的硬仗。一是形势变化快。陈水扁的“宪改”戏码喧腾一时，但在内外压力和各方因素制约下，加之他陷入“国务机要费”弊案，“宪改”步骤被打乱、进程被迟滞。但他又生一计，将“台独”活动的重点转向推动“入联公投”，企图通过“公投”，确定台湾是“主权独立的国家”，改变大陆和台湾同属一个中国的现状；二是，尽管陈水扁早已失去了大多数台湾民众的支持，但其把持台湾政权，掌控了岛内政经资源，对内强力通过行政手段、对外制造民意，裹挟台湾民众，欺骗国际舆论，增加了做工作的难度；三是，陈水扁再次使用“公投绑大选”的卑劣手法，以推动“台独”活动升级，控制议题，制造对抗，拉抬选情，打击对手，推动“入联公投”的事态与选情的白热化交织在一起，使斗争形势格外错综复杂。
这时的陈云林在台办主任的任上已经超期服役，为了打赢这场与“台独”势力的决战，他两年内率团四度出访美国与欧盟，做国际社会特别是主要国家和国家集团的工作，向他们说明“台独”的极端危险性与危害性，希望他们从维护台海和平和亚太地区稳定的共同利益出发，在遏制“台独”中发挥积极作用。在与众多西方官员、议员和学者打交道的过程中，并不总是彬彬有礼的无碍沟通，更多场合是“舌战群儒”。但陈云林和他的同事们坚定维护国家利益和地区和平的坦诚与执着，赢得了大多数人的尊重与认同。这两年，也是陈云林会见台湾人士最多的两年，交换意见的日程总是排得满满的，节假日也不例外。那是他一生中难忘的日日夜夜，对台工作的同志们，以高度负责的态度，不计艰辛、不计苦累、不计毁誉、不计得失、默默地做出了许多事情。每每想到这些，陈云林就会对他们感到一种由衷的歉意。
“艰难困苦，玉汝于成”，2008年3月22日，四场战役最终赢得全面胜利，这无论在两岸关系发展的历史上，还是在中国推进现代化建设的进程中，都具有重大而深远的意义。十几年来两岸关系的走向、台湾政局的演变终于出现了两岸同胞长期期待的结果，两岸关系从此进入了和平发展的新局面。
2008年5月26日，中国国民党重新在台湾执政。同样在南京禄口机场，陈云林与刚走下飞机的国民党主席吴伯雄再度拥抱时，“雨过天晴”成为他们对两岸关系历史性转折的共同描述。
重开两岸协商
邀请并接待吴伯雄主席来访，是陈云林在台办主任任上完成的最后一项重要工作。
这是一次极为重要的访问。国民党从在野党变为执政党，两党达成的共识，有没有变化?执政的国民党会不会延续2005年的两党共识?这些问题的答案关系到两岸关系未来发展的大局。在这次来访中，吴伯雄向胡锦涛总书记确认了国民党赓续两岸关系和平发展的大陆政策，同意两岸双方在“建立互信、搁置争议、求同存异、共创双赢”的基础上，开创两岸关系和平发展新局面。在马英九表示愿在“九二共识”基础上尽速恢复两岸协商后，吴伯雄又当面向胡锦涛总书记提出恢复海协、海基两会制度性协商的建议，同时也表达了希望新任海协会会长访台的愿望。陈云林为吴伯雄这次访问取得的重要成果感到由衷的喜悦。因为这标志着，在野的国民党和执政的国民党的政策完成了一次重大接续。这是他对于多年来关心他、爱护他、理解他的领导和同志们的一个交代。
6月2日，中央同意陈云林由中央台办、国务院台办主任转任海协会会长，负责两岸协商的工作。在此稍前，台湾方面也任命国民党副主席江丙坤出任海基会董事长。6月3日，海协会第二届理事会组成，并召开第一次会议，确定了先经济后政治、先易后难、循序渐进的协商步骤。6月12日至14日，海协会邀请海基会董事长江丙坤率团来访，两会在“九二共识”基础上恢复了中断9年之久的协商。
江董事长是陈云林的老朋友，早在2005年初，他即率团来访，开启了连战来访的前奏，为两岸关系改善做出了重要贡献。也许他们都为两岸关系和平发展做过一点事情，也许他们又都具有财经背景，在两岸同胞迫切需要加强两岸经济合作的时代潮流下，三年后，陈、江二人又开始在新的平台上共同努力。
按照两会交往的惯例，迎送江董事长的应该是海协会副会长。为了体现对江董事长的尊重，回应两岸同胞对两会复谈的高度关注，陈 云林特别在海基会下榻的酒店门口迎候江董事长夫妇。此后，江董事长也投桃报李，为两会交往新增了一项惯例。
两会重启协商，开局顺利，抓住两岸同胞迫切关注的大陆居民赴台旅游和两岸周末包机事宜，签署了《海峡两岸包机会谈纪要》和《海峡两岸关于大陆居民赴台旅游协议》。胡锦涛总书记会见江丙坤一行，充分肯定了两会恢复协商的成果与意义，指出这次会谈的成功举行，标志着两岸关系和平发展有一个良好的开端。
在这次北京会谈中，江丙坤当面向陈云林发出年内访台的邀请。陈云林接受了邀请。
首次赴台会谈
两岸关系的迅速改善与发展，引起了民进党及“台独”分裂势力的极大恐惧。民进党主席蔡英文声称，“陈云林来访时，一定会组织游行抗议活动”。极端“台独”势力在陈水扁的蛊惑下叫嚣并悬赏对他和代表团实施人身袭击。10月21日，在台南孔庙发生了少数极端“台独”分子暴力袭击海协会副会长张铭清的事件。10月25日，民进党、台联党、台湾社等“台独”势力联合举行大规模街头游行，集中攻击马英九无力改善台湾民生和实行“亲中”政策，并力图阻挠海协会代表团访台。当时的形势可谓黑云压城，很多朋友写信打电话劝陈云林慎重考虑时机，还有一些台湾朋友也劝他推迟访台。
原海协会会长汪道涵在世时，曾计划访台，但是因为“台独”势力破坏而未能实现。在新的两岸关系形势下，陈云林率团实现访台，将是两岸关系史上又一重大突破，第二次“陈江会谈”的宗旨是“加强两岸经济合作、深化两会协商进程、谋求两岸同胞福祉”，会谈所要解决的两岸直接通航、通邮、建立食品安全机制等问题，将给两岸同胞带来实实在在的利益。加之国际金融危机正对两岸经济关系造成严重冲击，亟需两岸双方携手迎接挑战，共克时艰。陈云林坚信，此行一定会获得大多数台湾同胞的理解和支持，决不能在“台独”势力的反对、威胁面前，止步不前。
11月3日，陈云林率海协会协商代表团在北京首都机场搭乘绘有奥运福娃标志的包机正式启程，开始了5天的台湾之行。在这短短的5天里，有许多将留下长远深刻影响的时刻，对陈云林来说，有几个时段在他记忆里尤为清晰：
11月3日中午，当包机飞至台湾上空，陈云林的心情百感交集，那是一块美丽而可爱的土地，也是一块历经沧桑和磨难的土地，更是一块他凝视了15年的土地。当他和这块土地如此接近时，内心涌起的那种宏大的历史感已经让其他情绪显得渺小。近百年来，台湾与大陆母亲的命运一起沉浮。今天，中华民族已踏上伟大复兴的历史征程，但同胞分离，金瓯尚缺，仍然是每一个中华儿女心中的痛。从事对台工作15年来，陈云林曾经不止一次地答应过台湾朋友，“去台湾看看那里的乡亲，看看那里的山河，这也是长久蕴育于心中的一个梦”。这一天他终于做到了。“那只是我为党和国家工作40余年的一个普通上午，但迈出的，却是两岸关系史上的重要一步。”陈云林说。
3日下午，陈云林和江董事长一起看望辜振甫先生的遗孀辜严倬云女士。汪道涵会长与辜振甫曾二度会晤，并相约1999年秋天在台北见面，但因“台独”分裂势力的阻挠，未能如愿。二老随后相继病逝，汪辜会谈遂成绝响。陈云林把拜访辜严倬云女士作为海协会代表团抵台后的首场活动，既是表达对汪辜二老为两岸关系发展所做出贡献的缅怀和敬仰，也是为了完成他们未尽的夙愿，告慰他们的在天之灵。
11月4日，陈云林与江丙坤在台北圆山饭店举行会谈，双方成功签署了《两岸空运协议》、《两岸海运协议》、《两岸邮政协议》、《两岸食品安全协议》。在签署协议的那一刻，陈云林心潮起伏，久久无法平静。从1979年1月1日全国人大常委会发表《告台湾同胞书》以来，大陆推动两岸“三通”的努力已持续了30年。而眼前即将签署的协议，将正式宣告两岸“三通”的基本实现。“那一刻，我想起了很多人，想起了首倡两岸‘三通’的改革开放的总设计师邓小平，想起了在纷繁复杂的台海局势中坚持为推进‘三通’运筹帷幄的几代中央领导人；想起了为‘三通’奔走呼号多年的两岸工商界朋友；为自己的水果卖不出去而愁眉不展的台湾农民朋友；那些遥望大陆百感交集的台湾老兵；那些来大陆求学或者去台湾旅游的两岸普通民众……如果说，那天促成的事情能够载入史册的话，那是因为它凝聚着无数人30年来的努力和期盼。”陈云林由衷感慨地说道。
11月5日晚，海协会代表团在晶华饭店出席吴伯雄举办的晚宴时，被民进党支持者围困了整整8个小时。陈云林之所以在酒店呆那么长时间，主要是为了避免引发冲突，甚至流血事件，而这正是那些干扰破坏两岸的极端“台独”势力所希望看到的。同时，代表团要维护应有的尊严。当时有朋友劝他从地下通道乘车返回，他没有答应，因为这是一个基本的尊严问题。他坚持从哪里进来，就从哪里出去。
从陈云林抵台的那一刻起，民进党和“台独”势力就举行了花样百出的抗议活动。出于对海基会和台湾有关方面维安考虑的尊重，陈云林取消了同许多台湾朋友见面的计划。然而，令人意外的是，他在宴会上又一次见到了不久前才在福建永定土楼见过的嘉义乡亲，他们专程从家乡赶往台北。看到乡亲们，让他倍加感受到广大台湾人民的支持和期待。事实已经充分证明，广大台湾民众对于两会协商是高度肯定的，希望通过两会协商，深化两岸交流合作，实现互利双赢，促进两岸关系和平发展。对于在晶华酒店外闹事的民众，陈云林一直认为他们是被一小撮“台独”分子蛊惑煽动而来。从某种意义上讲，他们中的大多数人也是无辜的被骗者，而历史会有一天让他们为自己的行为感到懊悔。
11月6日晚，在海协会答谢宴会上，百感交集的陈云林用“欣慰、憧憬、感谢”六个字概括了在台北期间的感受。他说，他欣慰的是，两会能够为两岸同胞做一些实实在在的事情，而且得到了两岸同胞的理解和支持；而憧憬的是，两岸关系和平发展的道路越走越宽广。同时，为了表达最真诚的谢意，7日早上，在临别台湾前，陈云林专门和夫人一起，向台湾朋友们三次鞠躬，分别感谢台湾有关方面的周到安排，圆山大饭店、台北101、晶华酒店、国宾饭店员工无微不至的服务，警察和维安人员的辛勤操劳。这三次鞠躬，陈云林把它们看作是一个整体，希望借此能表达对所有关心、支持两岸关系和平发展的台湾同胞的感谢和敬意。
第三次“陈江会谈”
在两会台北会谈解决了两岸直接通邮、通航等重要问题后，为进一步完善两岸直接“三通”，促进两岸经济往来正常化，陈云林与江丙坤于2009年4月在南京举行了第三次会谈。这次会谈签署了《海峡两岸金融合作协议》、《海峡两岸空运补充协议》、《海峡两岸共同打击犯罪及司法互助协议》等三项协议，并就大陆资本赴台投资事宜发表共识。其中，实现两岸定期航班，标志着两岸航空运输业务实现正常化，空中直航更加完善和规范，两岸人员往来迎来新局面；启动两岸金融合作，标志着两岸经济关系从实体经济发展到金融领域，迈出了新步伐；共同打击犯罪及开展司法互助，标志着两会协商从经济性议题扩展到社会性议题，丰富了新内涵；陆资入岛达成共识，标志着两岸经济往来从单项投资发展到双向投资，实现了新突破。
在短短不到一年的时间里，两会共计签署了九项协议，达成了一项共识，占16年来两会签署协议总和的5/7。对上述成果的感受，集中体现在两会互赠的礼品中。海基会赠送的皮塑取名为“丰收”，体现了对一年来两岸关系和平发展所取得成果的肯定，而海协会赠送的云锦取名为“锦绣”，则寓意着两岸关系和平发展的美好明天。
此外，双方在宴会菜单上也做了精心呼应。2008年11月，江丙坤在台北101大厦为海协会代表团举行题为“风云会”的欢迎晚宴。每一道菜名的设计都颇有深意，寄寓了大家对两岸关系发生重大变化的感受，对推进两岸协商、增进人民福祉的期望。时隔半年，在南京会谈上，陈云林也让海协会相应地设计了七道菜名，结合时局，托物抒怀，表达大家对两会制度化商谈进一步取得成果、两岸关系和平发展不断向前推进的感受与厚望。这七道菜名分别是“雨过天晴丰民物”、“春满五洲共和谐”、“凤鸣九天呈祥瑞”、“龙族一脉喜空前”、“两岸和衷方致远”、“牛转乾坤谱新篇”、“果香露芳庆圆满”，与海基会在台北设计的七道菜名恰好对应，一时被传为两会商谈的又一段佳话。
回顾新中国成立以来，两岸关系走过的60年的风雨历程，陈云林满怀深情地说：“当前，两岸关系和平发展的良好局面来之不易，当倍加珍惜。尽管前进道路上还会出现困难和阻碍，但只要坚定信心、不懈努力，紧紧依靠两岸同胞，就一定能够开创两岸关系和平发展新局面，为两岸和平统一奠定更坚实的基础和更有利的条件，从而迎来中华民族伟大复兴的锦绣前程。”
责编 张 桦
2009年4月26日，古城南京，暮春的中山北麓显得尤为葱郁。下午15时，在紫金山庄紫金厅，满面笑容的海协会会长陈云林同台湾海基会董事长江丙坤一起走向签字台，在众多记者的见证下，在协议文本上郑重地签下了自己的名字。刹那间，掌声响起……这是第三次“陈江会谈”最令人期待的一幕。
自2008年5月以来，两岸关系实现历史性转折，两岸受权团体海协会与台湾海基会三度举行会谈，成功签署了九项协议并达成一项共识。
在这硕果累累的背后，我们与本文主人公一起回忆、评点过去和正在发生的两岸故事。
初任国台办主任
1941年12月，陈云林出生于沦陷的东北。思归心切和家园眷恋是陈云林与生俱来的情结。台湾和东北都曾有过被日本军国主义统治的惨痛经历，因此在小学期间学唱台湾岛歌曲时，陈云林就对台湾有一种特殊的感情。说起为什么能够做对台工作，他感慨地说：“这也许是一种缘分吧。”
1966年，毕业于北京农业大学土壤化学系的陈云林被分配到黑龙江省的一家化工企业。后来，他一步步从工人当上了厂长。不久，他被调任齐齐哈尔市任常委、计委主任，1983年被选为市长。1984年末，他被调任黑龙江省任副书记、常务副省长。
1992年邓小平同志发表重要的南巡讲话，1993年4月两岸举行“汪辜会谈”，大陆掀起新一波改革高潮，台商赴大陆投资也出现了井喷式增长。由于对台经济工作事情很多，任务繁重，中央考虑选择一个资历、经验合适的人协助时任台办主任王兆国分管对台经济和日常工作。就这样，1994年初春，陈云林从黑龙江省常务副省长的位置上被调到中共中央台湾工作办公室、国务院台湾事务办公室工作，担任常务副主任。1996年11月，陈云林接任主任，一干就是15年。
这次调任是陈云林人生的一次重大转折。那年他53岁，正值“五十而知天命”的年纪。尽管对于那片他曾工作奋斗近30载的黑土地饱含眷恋，但在致力于国家统一这份神圣责任面前，他更愿意迎接新的挑战。为了更好地贯彻邓小平同志关于对台经济工作的战略构想，刚刚就任新的职务不久，陈云林按照中央的指示精神，全力投入“全国对台经济工作会议”的筹备工作，同相关部委共同研拟出台了一系列对台经济工作的重要决策。由于会议再次明确了对台商投资采取“同等优先、适度放宽”的政策，因此在继续吸引台湾劳动密集型企业的同时，大陆方面充分利用台湾岛内产业转型，极大地推动了台湾技术密集型产业和前500强的大企业前来投资。之后，台办会同商务部认真贯彻全国人大常委会通过的“台商投资保护法”和“实施细则”，鼓励和保护台商投资的正当权益，成功地挫败了李登辉为遏制投资大陆热而制定的“南向政策”、“戒急用忍”政策。两岸经贸交往不断扩大，成为两岸关系中最活跃的因素。在这期间，陈云林还与台湾工商界的重要人士初步建立了相互信任的良好关系。从上世纪90年代初直到今天，由于中央实施的正确的方针政策，对台经济合作规模从小到大，领域不断扩大、层次不断提高，形成了互利双赢的新局面。
几乎是同一时间，两岸关系政治层面的问题也越来越多，呈现出错综复杂的新形势。国际上，冷战结束后，美国为首的西方国家提升与台湾的实质关系，向台出售先进武器，加紧“以台制华”。在岛内，李登辉在集党、政、军大权于一身后，便逐步暴露出分裂国家的“台独”真面目。两岸双方斗争的焦点集中体现在坚持还是背离“一个中国”原则的问题上。特别是2000年陈水扁上台以后，不断推动“台湾法理独立”活动，严重威胁着中国主权和领土完整，以及和平统一的前景、台海局势的和平稳定。
从1995年至2002年的七年时间里，针对李登辉访美制造“两个中国”、公开抛出“两国论”以及陈水扁鼓吹“一边一国论”，党中央领导全国人民，并团结海内外华人华侨，同“台独”分裂势力进行了三场针锋相对的斗争，直接打击了“台独”分裂势力的气焰。
作为这个时期的台办主任，陈云林担子相当沉重。中央台办、国务院台办担负起阻击“台独”分裂势力及其活动的艰巨任务，汇聚各方面力量，坚定地、毫不妥协地同“台独”势力进行坚决的斗争，并取得了一次又一次的胜利。
促成连战、宋楚瑜来访
2005年春夏，中共中央和胡锦涛总书记高瞻远瞩，决定邀请中国国民党主席连战和亲民党主席宋楚瑜来大陆访问，就两党结束过去、面向未来、为中华民族的伟大复兴共同努力交换意见。胡总书记的邀请是通过陈云林接受新华社记者采访的方式发出的。4月1日，连战主席对此正式表示感谢和欣然接受。4月26日，陈云林受中央委托，赶赴南京禄口机场迎接连战一行。那一天艳阳高照，万里无云，连先生出现在飞机舱口的那一刻，全世界的目光在这里聚焦，海峡两岸同胞、海内外华侨、华人以无比兴奋的心情，目睹了连战先生代表的中国国民党跨出的穿越60年历史风云的重要一步。5月5日，陈云林又赴西安机场迎接亲民党主席宋楚瑜一行。事非经过不知难，为了这一刻，陈云林和他的同事们曾经历过无数紧张、充满波折的日日夜夜，终于以善意和诚意，换得了双方的行动。为了这一刻，连战先生、宋楚瑜先生克服种种干扰，展现了对中华民族负责的坚定信念和超人勇气。
4月29日下午和5月12日下午，胡锦涛总书记在北京人民大会堂福建厅先后与连战、宋楚瑜举行正式会谈，发表新闻公报和会谈公报，双方确立了反“台独”、坚持“九二共识”两大共同政治基础，并从政治、经济、文化、军事、对外关系等方面向两岸同胞揭示了和平发展、互利双赢的前景。他们求同存异，为遏制“台独”、维护两岸同胞利益、推动两岸关系向着和平稳定的方向发展所举行的“历史性握手”，奏响了两岸关系以和平发展为主题的新时代序曲。
在此期间，在中央有关部门授权下，陈云林宣布了给予台湾农产品零关税待遇、赠送台湾同胞一对大熊猫、对在大陆高校就读的台湾学生按照大陆学生标准同等收费等惠台政策。在台办主任任上，陈云林推动出台了63项有利于扩大两岸交流、增进两岸同胞利益的政策措施。这些措施，都是在广泛听取 台湾各界人士的建设性意见后适时推出的，用行动向台湾民众展现了祖国大陆改善和发展两岸关系的诚意。
在接待连、宋来访的过程中，有许多鲜为人知的感人细节：在有关方面的大力支持下，台办找到了连战的祖父连横恢复中国国籍的户籍薄和宋楚瑜家族的族谱，协助连、宋二人寻找、修缮先人故迹、家族墓地，这一切使他们深受感动。
大陆同胞自发的热情的欢迎场面贯穿了连、宋来访的每场公开活动。连战拜谒中山陵时，现场早已聚集了大批自发前来的南京市民。连战抵达后，现场掌声雷动，中山陵392级台阶两旁都站满了人，场面壮观。本来十分钟就可以走完的路，足足用了半个多小时。在参观夫子庙、夜游秦淮河时，连战沿途受到南京民众的夹道欢迎。一些台湾记者不相信群众都是自发来的，就钻入人群到处询问，最后他们感慨地说：“这样的同胞情谊和感人场面，我们在台湾已经很多年没有见到了。”宋楚瑜是个爱动感情的人，一路上在热烈的氛围下控制着自己的情绪，当他回到湘潭老家祭祖时看到田头、房顶上那么多陌生而又亲切的面孔时，再也忍不住眼中的泪水。
连战和宋楚瑜的出身、经历、性格虽然有着明显不同，但是他们都是台湾岛内在两岸关系上深具前瞻眼光、充满政治勇气的政党领袖，都有深厚的民族情怀和对两岸关系和平发展历史潮流的深刻把握。他们来访后，国共两党构建了交流平台。迄今为止，两岸领导人已举行了三次会晤，举办了五届两岸经贸文化论坛，两党基层组织全方位开展了对口交流。这些成果，有效地遏制了“台独”活动，为日后两岸关系的转折奠定了坚实的基础。
迎接雨过天晴
面对刚刚出现的两岸关系和平稳定的发展势头，陷入困境的陈水扁决定推进激进的“台独”路线，进行孤注一掷的反扑。2006年2月，陈水扁悍然宣布终止“国统会”运作和“国统纲领”适用。10月，授意抛出所谓“中华民国第二共和宪法草案”。2007年6月，公然推动举办“以台湾名义加入联合国”的公民投票。台海局势再次陷入紧张对抗、千钧一发的危险边缘。为遏制陈水扁一波又一波“台独”冒险，中央针对台湾局势的复杂变化，相继提出坚决制止陈水扁当局通过“宪改”谋求台湾“法理独立”、全力挫败“入联公投”、通过遏制“台独”和维护台海局势稳定，为泛蓝政党赢得选举创造有利条件等四项任务。
有三个特点显示出这是一场环环相扣、惊心动魄、前所未有的硬仗。一是形势变化快。陈水扁的“宪改”戏码喧腾一时，但在内外压力和各方因素制约下，加之他陷入“国务机要费”弊案，“宪改”步骤被打乱、进程被迟滞。但他又生一计，将“台独”活动的重点转向推动“入联公投”，企图通过“公投”，确定台湾是“主权独立的国家”，改变大陆和台湾同属一个中国的现状；二是，尽管陈水扁早已失去了大多数台湾民众的支持，但其把持台湾政权，掌控了岛内政经资源，对内强力通过行政手段、对外制造民意，裹挟台湾民众，欺骗国际舆论，增加了做工作的难度；三是，陈水扁再次使用“公投绑大选”的卑劣手法，以推动“台独”活动升级，控制议题，制造对抗，拉抬选情，打击对手，推动“入联公投”的事态与选情的白热化交织在一起，使斗争形势格外错综复杂。
这时的陈云林在台办主任的任上已经超期服役，为了打赢这场与“台独”势力的决战，他两年内率团四度出访美国与欧盟，做国际社会特别是主要国家和国家集团的工作，向他们说明“台独”的极端危险性与危害性，希望他们从维护台海和平和亚太地区稳定的共同利益出发，在遏制“台独”中发挥积极作用。在与众多西方官员、议员和学者打交道的过程中，并不总是彬彬有礼的无碍沟通，更多场合是“舌战群儒”。但陈云林和他的同事们坚定维护国家利益和地区和平的坦诚与执着，赢得了大多数人的尊重与认同。这两年，也是陈云林会见台湾人士最多的两年，交换意见的日程总是排得满满的，节假日也不例外。那是他一生中难忘的日日夜夜，对台工作的同志们，以高度负责的态度，不计艰辛、不计苦累、不计毁誉、不计得失、默默地做出了许多事情。每每想到这些，陈云林就会对他们感到一种由衷的歉意。
“艰难困苦，玉汝于成”，2008年3月22日，四场战役最终赢得全面胜利，这无论在两岸关系发展的历史上，还是在中国推进现代化建设的进程中，都具有重大而深远的意义。十几年来两岸关系的走向、台湾政局的演变终于出现了两岸同胞长期期待的结果，两岸关系从此进入了和平发展的新局面。
2008年5月26日，中国国民党重新在台湾执政。同样在南京禄口机场，陈云林与刚走下飞机的国民党主席吴伯雄再度拥抱时，“雨过天晴”成为他们对两岸关系历史性转折的共同描述。
重开两岸协商
邀请并接待吴伯雄主席来访，是陈云林在台办主任任上完成的最后一项重要工作。
这是一次极为重要的访问。国民党从在野党变为执政党，两党达成的共识，有没有变化?执政的国民党会不会延续2005年的两党共识?这些问题的答案关系到两岸关系未来发展的大局。在这次来访中，吴伯雄向胡锦涛总书记确认了国民党赓续两岸关系和平发展的大陆政策，同意两岸双方在“建立互信、搁置争议、求同存异、共创双赢”的基础上，开创两岸关系和平发展新局面。在马英九表示愿在“九二共识”基础上尽速恢复两岸协商后，吴伯雄又当面向胡锦涛总书记提出恢复海协、海基两会制度性协商的建议，同时也表达了希望新任海协会会长访台的愿望。陈云林为吴伯雄这次访问取得的重要成果感到由衷的喜悦。因为这标志着，在野的国民党和执政的国民党的政策完成了一次重大接续。这是他对于多年来关心他、爱护他、理解他的领导和同志们的一个交代。
6月2日，中央同意陈云林由中央台办、国务院台办主任转任海协会会长，负责两岸协商的工作。在此稍前，台湾方面也任命国民党副主席江丙坤出任海基会董事长。6月3日，海协会第二届理事会组成，并召开第一次会议，确定了先经济后政治、先易后难、循序渐进的协商步骤。6月12日至14日，海协会邀请海基会董事长江丙坤率团来访，两会在“九二共识”基础上恢复了中断9年之久的协商。
江董事长是陈云林的老朋友，早在2005年初，他即率团来访，开启了连战来访的前奏，为两岸关系改善做出了重要贡献。也许他们都为两岸关系和平发展做过一点事情，也许他们又都具有财经背景，在两岸同胞迫切需要加强两岸经济合作的时代潮流下，三年后，陈、江二人又开始在新的平台上共同努力。
按照两会交往的惯例，迎送江董事长的应该是海协会副会长。为了体现对江董事长的尊重，回应两岸同胞对两会复谈的高度关注，陈 云林特别在海基会下榻的酒店门口迎候江董事长夫妇。此后，江董事长也投桃报李，为两会交往新增了一项惯例。
两会重启协商，开局顺利，抓住两岸同胞迫切关注的大陆居民赴台旅游和两岸周末包机事宜，签署了《海峡两岸包机会谈纪要》和《海峡两岸关于大陆居民赴台旅游协议》。胡锦涛总书记会见江丙坤一行，充分肯定了两会恢复协商的成果与意义，指出这次会谈的成功举行，标志着两岸关系和平发展有一个良好的开端。
在这次北京会谈中，江丙坤当面向陈云林发出年内访台的邀请。陈云林接受了邀请。
首次赴台会谈
两岸关系的迅速改善与发展，引起了民进党及“台独”分裂势力的极大恐惧。民进党主席蔡英文声称，“陈云林来访时，一定会组织游行抗议活动”。极端“台独”势力在陈水扁的蛊惑下叫嚣并悬赏对他和代表团实施人身袭击。10月21日，在台南孔庙发生了少数极端“台独”分子暴力袭击海协会副会长张铭清的事件。10月25日，民进党、台联党、台湾社等“台独”势力联合举行大规模街头游行，集中攻击马英九无力改善台湾民生和实行“亲中”政策，并力图阻挠海协会代表团访台。当时的形势可谓黑云压城，很多朋友写信打电话劝陈云林慎重考虑时机，还有一些台湾朋友也劝他推迟访台。
原海协会会长汪道涵在世时，曾计划访台，但是因为“台独”势力破坏而未能实现。在新的两岸关系形势下，陈云林率团实现访台，将是两岸关系史上又一重大突破，第二次“陈江会谈”的宗旨是“加强两岸经济合作、深化两会协商进程、谋求两岸同胞福祉”，会谈所要解决的两岸直接通航、通邮、建立食品安全机制等问题，将给两岸同胞带来实实在在的利益。加之国际金融危机正对两岸经济关系造成严重冲击，亟需两岸双方携手迎接挑战，共克时艰。陈云林坚信，此行一定会获得大多数台湾同胞的理解和支持，决不能在“台独”势力的反对、威胁面前，止步不前。
11月3日，陈云林率海协会协商代表团在北京首都机场搭乘绘有奥运福娃标志的包机正式启程，开始了5天的台湾之行。在这短短的5天里，有许多将留下长远深刻影响的时刻，对陈云林来说，有几个时段在他记忆里尤为清晰：
11月3日中午，当包机飞至台湾上空，陈云林的心情百感交集，那是一块美丽而可爱的土地，也是一块历经沧桑和磨难的土地，更是一块他凝视了15年的土地。当他和这块土地如此接近时，内心涌起的那种宏大的历史感已经让其他情绪显得渺小。近百年来，台湾与大陆母亲的命运一起沉浮。今天，中华民族已踏上伟大复兴的历史征程，但同胞分离，金瓯尚缺，仍然是每一个中华儿女心中的痛。从事对台工作15年来，陈云林曾经不止一次地答应过台湾朋友，“去台湾看看那里的乡亲，看看那里的山河，这也是长久蕴育于心中的一个梦”。这一天他终于做到了。“那只是我为党和国家工作40余年的一个普通上午，但迈出的，却是两岸关系史上的重要一步。”陈云林说。
3日下午，陈云林和江董事长一起看望辜振甫先生的遗孀辜严倬云女士。汪道涵会长与辜振甫曾二度会晤，并相约1999年秋天在台北见面，但因“台独”分裂势力的阻挠，未能如愿。二老随后相继病逝，汪辜会谈遂成绝响。陈云林把拜访辜严倬云女士作为海协会代表团抵台后的首场活动，既是表达对汪辜二老为两岸关系发展所做出贡献的缅怀和敬仰，也是为了完成他们未尽的夙愿，告慰他们的在天之灵。
11月4日，陈云林与江丙坤在台北圆山饭店举行会谈，双方成功签署了《两岸空运协议》、《两岸海运协议》、《两岸邮政协议》、《两岸食品安全协议》。在签署协议的那一刻，陈云林心潮起伏，久久无法平静。从1979年1月1日全国人大常委会发表《告台湾同胞书》以来，大陆推动两岸“三通”的努力已持续了30年。而眼前即将签署的协议，将正式宣告两岸“三通”的基本实现。“那一刻，我想起了很多人，想起了首倡两岸‘三通’的改革开放的总设计师邓小平，想起了在纷繁复杂的台海局势中坚持为推进‘三通’运筹帷幄的几代中央领导人；想起了为‘三通’奔走呼号多年的两岸工商界朋友；为自己的水果卖不出去而愁眉不展的台湾农民朋友；那些遥望大陆百感交集的台湾老兵；那些来大陆求学或者去台湾旅游的两岸普通民众……如果说，那天促成的事情能够载入史册的话，那是因为它凝聚着无数人30年来的努力和期盼。”陈云林由衷感慨地说道。
11月5日晚，海协会代表团在晶华饭店出席吴伯雄举办的晚宴时，被民进党支持者围困了整整8个小时。陈云林之所以在酒店呆那么长时间，主要是为了避免引发冲突，甚至流血事件，而这正是那些干扰破坏两岸的极端“台独”势力所希望看到的。同时，代表团要维护应有的尊严。当时有朋友劝他从地下通道乘车返回，他没有答应，因为这是一个基本的尊严问题。他坚持从哪里进来，就从哪里出去。
从陈云林抵台的那一刻起，民进党和“台独”势力就举行了花样百出的抗议活动。出于对海基会和台湾有关方面维安考虑的尊重，陈云林取消了同许多台湾朋友见面的计划。然而，令人意外的是，他在宴会上又一次见到了不久前才在福建永定土楼见过的嘉义乡亲，他们专程从家乡赶往台北。看到乡亲们，让他倍加感受到广大台湾人民的支持和期待。事实已经充分证明，广大台湾民众对于两会协商是高度肯定的，希望通过两会协商，深化两岸交流合作，实现互利双赢，促进两岸关系和平发展。对于在晶华酒店外闹事的民众，陈云林一直认为他们是被一小撮“台独”分子蛊惑煽动而来。从某种意义上讲，他们中的大多数人也是无辜的被骗者，而历史会有一天让他们为自己的行为感到懊悔。
11月6日晚，在海协会答谢宴会上，百感交集的陈云林用“欣慰、憧憬、感谢”六个字概括了在台北期间的感受。他说，他欣慰的是，两会能够为两岸同胞做一些实实在在的事情，而且得到了两岸同胞的理解和支持；而憧憬的是，两岸关系和平发展的道路越走越宽广。同时，为了表达最真诚的谢意，7日早上，在临别台湾前，陈云林专门和夫人一起，向台湾朋友们三次鞠躬，分别感谢台湾有关方面的周到安排，圆山大饭店、台北101、晶华酒店、国宾饭店员工无微不至的服务，警察和维安人员的辛勤操劳。这三次鞠躬，陈云林把它们看作是一个整体，希望借此能表达对所有关心、支持两岸关系和平发展的台湾同胞的感谢和敬意。
第三次“陈江会谈”
在两会台北会谈解决了两岸直接通邮、通航等重要问题后，为进一步完善两岸直接“三通”，促进两岸经济往来正常化，陈云林与江丙坤于2009年4月在南京举行了第三次会谈。这次会谈签署了《海峡两岸金融合作协议》、《海峡两岸空运补充协议》、《海峡两岸共同打击犯罪及司法互助协议》等三项协议，并就大陆资本赴台投资事宜发表共识。其中，实现两岸定期航班，标志着两岸航空运输业务实现正常化，空中直航更加完善和规范，两岸人员往来迎来新局面；启动两岸金融合作，标志着两岸经济关系从实体经济发展到金融领域，迈出了新步伐；共同打击犯罪及开展司法互助，标志着两会协商从经济性议题扩展到社会性议题，丰富了新内涵；陆资入岛达成共识，标志着两岸经济往来从单项投资发展到双向投资，实现了新突破。
在短短不到一年的时间里，两会共计签署了九项协议，达成了一项共识，占16年来两会签署协议总和的5/7。对上述成果的感受，集中体现在两会互赠的礼品中。海基会赠送的皮塑取名为“丰收”，体现了对一年来两岸关系和平发展所取得成果的肯定，而海协会赠送的云锦取名为“锦绣”，则寓意着两岸关系和平发展的美好明天。
此外，双方在宴会菜单上也做了精心呼应。2008年11月，江丙坤在台北101大厦为海协会代表团举行题为“风云会”的欢迎晚宴。每一道菜名的设计都颇有深意，寄寓了大家对两岸关系发生重大变化的感受，对推进两岸协商、增进人民福祉的期望。时隔半年，在南京会谈上，陈云林也让海协会相应地设计了七道菜名，结合时局，托物抒怀，表达大家对两会制度化商谈进一步取得成果、两岸关系和平发展不断向前推进的感受与厚望。这七道菜名分别是“雨过天晴丰民物”、“春满五洲共和谐”、“凤鸣九天呈祥瑞”、“龙族一脉喜空前”、“两岸和衷方致远”、“牛转乾坤谱新篇”、“果香露芳庆圆满”，与海基会在台北设计的七道菜名恰好对应，一时被传为两会商谈的又一段佳话。
回顾新中国成立以来，两岸关系走过的60年的风雨历程，陈云林满怀深情地说：“当前，两岸关系和平发展的良好局面来之不易，当倍加珍惜。尽管前进道路上还会出现困难和阻碍，但只要坚定信心、不懈努力，紧紧依靠两岸同胞，就一定能够开创两岸关系和平发展新局面，为两岸和平统一奠定更坚实的基础和更有利的条件，从而迎来中华民族伟大复兴的锦绣前程。”
责编 张 桦