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利用16SrDNARFLP、16S-23S rDNARFLP和16SrDNA序列分析方法，对分离自宁夏和内蒙古阿拉善地区的沙冬青根瘤菌进行了遗传多样性和系统发育分析。结果表明，分离自不同地区沙冬青根瘤菌的44株测试菌株分别归属于中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium）、叶杆菌属（Phylobacterium）、中华根瘤菌属（Sinorhizobium）、根瘤菌属（Rhizobium）、土壤杆菌属（Agrobacterium）5个属种。受寄主和地理环境因素的影响，沙冬青根瘤菌具有丰富的遗传多样性。