目的探究内口黏膜瓣推移修补辅助瘘道部分剥除治疗高位肛瘘的临床疗效。方法选取2015年1月~2016年7月我院收治的86例高位肛瘘患者,根据抽签法分为观察组和对照组,每组43例。观察组采取内口黏膜瓣推移修补辅助瘘道部分剥除术,对照组根据传统方式完成肛瘘切开挂线术。比较两组患者临床疗效,肛门直肠压力情况,肛门功能情况,术后疼痛情况,后遗症情况。结果手术后,观察组临床总有效率和对照组比较差异无统计学意义(P>0.05)。观察组肛管静息压、直肠静息压、肛管收缩压高于对照组(P<0.05)。观察组的肛门功能主观评分、肛门指诊评分低于对照组(P<0.05)。观察组的VAS评分低于对照组(P<0.05)。观察组的肛门变形、肛门部分失禁、肛门潮湿并发症发生率低于对照组(P<0.05)。结论内口黏膜瓣推移修补辅助瘘道部分剥除治疗高位肛瘘,给患者带来的痛苦较轻,刺激反应小,有利于患者肛门功能的恢复,并发症发生率低,临床疗效良好。