目的:建立硫代反义寡核苷酸CT102及其相关杂质的反相离子对高效液相色谱(IP-RP-HPLC)分析方法。方法:对可能存在的3’n-1、5’n-1序列、5’(P=S/O)不完全硫代序列与CT102全长序列(n)的分离情况进行了考察,采用的色谱柱为XBridge OST C18 Column(50 mm×4.6 mm,2.5μm);流动相A为100 mmol.L-1 HFIP/31.6 mmol.L-1 TEA,10%甲醇(V/V));流动相B为100 mmol.L-1HFIP/31.6 mmol.L-1TEA,20%甲醇,洗脱梯度为0～12 min,17%→43%B;柱温为55℃;流速为0.4 mL.min-1;检测波长为260 nm。结果:在优化的条件下,合成过程中的主要杂质5’n-1、3’n-1以及5’(P=S/O)均能够实现与全长全硫代序列n基线分离。该法用于含量测定,CT102在50-600μg·mL-1浓度范围内线性良好,r=0.9999,检出限为2.5μg·mL-1,精密度与重现性良好,RSD小于2%,平均回收率为100.1%,(RSD=1.7%,n=9)。结论:该方法可应用于CT102原料药的纯度检测和含量测定,为该药物的深入研究提供保证。