为探索正茬与迎茬种植方式对大豆根际土壤微生物群落组成的影响，分析导致大豆迎茬障碍形成的主要病原微生物，研究大豆迎茬障碍的形成机制，进而为其生物防治提供一定的理论基础，本研究采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术分析正茬与迎茬大豆根际土壤微生物群落组成。结果表明：大豆迎茬种植在一定程度上降低了土壤细菌群落丰度和多样性，而增加了土壤真菌群落丰度和多样性。正茬与迎茬大豆根际土壤微生物群落组成和主要优势菌群所占比例均存在较大差异。酸杆菌门（Acidobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）分别为正茬和迎茬大豆根际土壤细菌群落中最具优势的细菌门。镰孢霉属（Fusarium）和粗糙孔菌属（Subulicystidium）分别为正茬和迎茬大豆根际土壤真菌群落中最具优势的属。