茭白荧光定量RT-PCR内参基因表达稳定性评价

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茭白是禾本科多年生水生蔬菜,其产品器官是由菰(Zizania latifolia)与菰黑粉菌(Ustilago esculenta)共生膨大形成的可食用肉质茎。选取合适的茭白荧光定量RT-PCR内参基因,是研究菰和菰黑粉菌互作中茭白基因表达模式的基础。本研究以茭白不同时期的根、叶片、叶鞘、茎尖和肉质茎为研究材料,通过qRT-PCR技术检测β-Actin、Actin3、β-tubulin、GAPDH、UBQ5、UBC1、PK、elf1α、eIF4a、SFua2a、18S rRNA等11个内参基因的表达情况,借助内参基因评价软件GeNorm、Normfinder和BestKeeper以及综合评价软件RefFinder对候选内参基因的表达稳定性进行分析,筛选出茭白适宜的内参基因,并使用茭白ZlADR1基因进行验证分析。结果表明,SFua2a和eIF4a,其次Actin3在所有样品中表达稳定性较好,适合作为茭白基因表达分析的内参基因。
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