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目的用RAPD和ISSR方法分析了4种正品龙胆的亲缘关系及遗传多样性,为正品龙胆的品种鉴定及栽培育种提供了分子生物学依据.方法优化RAPD及ISSR的PCR反应体系,对产物琼脂糖凝胶电泳结果进行数据统计.结果从100个RAPD引物和32个ISSR引物中分别筛选出10个RAPD引物和4个ISSR引物.通过遗传距离系数UPGMA聚类法分析数据,构建类聚关系树系图.结论RAPD及ISSR的PCR反应体系可以获得理想的实验结果,适用于龙胆品种遗传多样性及亲缘关系的分析.