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目的分析上消化道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumors,GISTs)及平滑肌瘤的超声内镜(Endoscopic Ultrasonography,EUS)及免疫组化特征以辅助鉴别诊断二者。方法以我院2013年9月至2017年9月的119例上消化道间质瘤和平滑肌瘤患者为研究对象,回顾性分析二者的内镜及免疫组化特征差异。结果 119例患者中,男性46例(38.66%),女性73例(61.34%)。普通胃镜下间质瘤和平滑肌瘤表面状况差异无统计学意义。病变位于食管51例(42.86%),食管病变大多为平滑肌瘤(66.67%),大多起源于固有肌层(52.94%)和黏膜肌层(39.22%);病变位于胃部68例(57.14%),胃部病变大多为间质瘤(89.70%),大多起源于固有肌层(92.65%)。平滑肌瘤主要起源于固有肌层(51.22%)和黏膜肌层(43.90%),多为低回声(78.05%)和中低混合回声(21.95%),大小多≤1cm(73.17%),大多数回声均匀(90.24%),具有SMA、Desmin高表达的特点;间质瘤主要起源于固有肌层(88.46%),大小多>2cm(48.72%)和≤1cm(30.77%),多为低回声(67.95%)和中低混合回声(30.77%),回声均匀者占60.26%,不均匀者占39.74%,具有CD117、Dog-1、CD34高表达的特点。结论间质瘤和平滑肌瘤在普通胃镜下表现相似,但可通过超声内镜及免疫组化辅助鉴别诊断。