头颈部鳞状细胞癌差异表达基因的生物信息学分析

来源 :中国医学装备 | 被引量 : 0次 | 上传用户：capfhn

【摘要】

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目的:采用生物信息学技术挖掘头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)差异表达基因(DEGs)和信号通路,为HNSCC的治疗寻找新的治疗靶点。方法:从基因表达综合(GEO)数据库下载基因芯片数据集GS

【作者】

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张静窦富贤秦博宇胡毅

【机构】

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解放军总医院第一医学中心肿瘤内科,解放军总医院第一医学中心病理科

【出处】

：

中国医学装备

【发表日期】

：

2021年2期

【关键词】

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头颈部鳞状细胞癌(HNSCC) 差异表达基因(DEGs) 生物信息学 Head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC)

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目的:采用生物信息学技术挖掘头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)差异表达基因(DEGs)和信号通路,为HNSCC的治疗寻找新的治疗靶点。方法:从基因表达综合(GEO)数据库下载基因芯片数据集GSE6631,利用GEO2R筛选DEGs。采用注释、可视化和整合发现数据库(DAVID)对DEGs进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;通过蛋白质相互作用的String数据库和Cytoscape软件构建DEGs对应的蛋白质相互作用网络,并从网络中筛选出核心基因。利用基因表达谱分析(G

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