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针对工程中FFT存在滤波误差的问题对FFT的滤波原理进行了推导,分析指出了FFT运算与复调制滤波器组滤波运算之间存在的差异,推导出了误差项,并对该误差项造成的相频响应非线性和通带波纹增大进行了仿真分析;对该频率响应误差造成的滤波性能下降进行了仿真验证;针对误差形成原理给出了消除误差的方法;最后分析指出了FFT滤波存在固有的相位超前现象,并根据其产生的原因给出了有效应对措施。