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目的 了解2006-2011年间青岛地区流行的B型流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2006-2011年间青岛地区分离的B型流感病毒，提取病毒RNA，应用逆转录聚合酶链反应（ RT-PCR）扩增各基因片段，并进行序列测定；Sequencher 软件完成序列拼接。 MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果在血凝素（ HA）基因进化树上，Victoria系V1分支为B/Malaysia/2506/2004样毒株，包含2006-2009年13个毒株，V2分支为B/Brisbane/60/2008样毒株，包含2009-2011年12个毒株；Yamagata 系全部为 B/Florida/4/2006样毒株， Y1分支包含2006-2008年5个毒株，Y2分支包含2010-2011年7个毒株。全基因组分析表明V2分支3个毒株发生了5＋3重配，1个毒株发生了1＋7重配，重配株均与前一季及当季疫苗株同亚型；HA进化树上处于Yamagata系的毒株全部属于基因型2，处于Victoria系的毒株全部属于基因型15；HA1蛋白与疫苗株进行比较：Victoria系分离株主要变异位点包括H14Q、L58P、N129S、I146V、N171D、R279K；Yamaga-ta系分离株主要变异位点包括R48K、K88R、P108A、N116K、S150I、N165Y、D196N、N202S、S229G；位点116和129、位点150、位点165、位点196和202分处以往证实经历阳性选择的抗原表位120环、150环、160环和190环。结论2006-2011年青岛地区B型流感病毒两系共流行，并且持续进化；疫苗的使用可为同系病毒造成选择压力，而双组分的B型流感疫苗可能更为有效。