干旱半干旱区农业可持续发展不仅面临干旱胁迫,还面临连作障碍带来的负面影响.压砂方式为宁夏中部旱区硒砂瓜种植提供了有利条件.然而,长时间连作导致自根苗硒砂瓜大面积死亡,只能通过嫁接方式缓解连作障碍.对于不同连作方式(连作自根苗后直接连作嫁接苗以及连作自根苗后换砂处理后连作嫁接苗)对压砂地土壤微生物群落结构的影响缺乏深入认识.本文采用Illumina Miseq测序技术对不同连作方式压砂层土壤和土壤层细菌群落结构和真菌群落结构进行了分析.结果 表明,连作方式和不同土层对细菌群落结构和真菌群落结构都有显著影响.连作方式S3(自根苗连作11年+换砂2年+嫁接苗连作3年)和S4(自根苗连作12年+嫁接苗连作4年)土壤层细菌群落结构发生显著变化的属主要包括Streptomyces、Gaiella、Ensifer、Nordella、Mesorhizobium;真菌群落结构发生显著变化的属主要包括Fusarium、Mortierella、Neocosmospora、Setophoma、Cladosporium、Chrysospori-am、Periconia、Penicillium、Sarocladium等.而连作方式S4土壤层大量富集了Neocosmospo-ra、Chrysosporium、Lectera,特别是Fusarium和Paracylindrocarpon真菌类群,其中Fusarium的相对多度显著高于连作方式S3.这些结果为评价不同连作方式导致土壤微生物群落结构失衡提供科学数据.