以河南省郑州、周口和信阳的6个苦瓜种植园区的苦瓜枯萎病样品为试材,采用组织分离法分离苦瓜枯萎病菌分离物,并根据分离物的培养性状、菌落及孢子形态特征,结合分子系统学分析和致病性测定,对苦瓜枯萎病菌进行了分类鉴定,以期明确河南省苦瓜枯萎病菌分离物的分类地位,并为苦瓜枯萎病综合防治提供参考依据。结果表明:34株分离物均为苦瓜枯萎病菌尖孢镰孢菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.momodicae Sun&Huang)。分离物除了侵染苦瓜外,弱侵染丝瓜和瓠瓜,不侵染南瓜、甜瓜、西瓜和黄瓜。基于ITS、EF-1α和β-tubulin的多基因序列系统发育树的分析结果表明,来源于郑州和信阳的苦瓜枯萎病菌与以上瓜类专化型的亲缘关系较近,除郑州分离物HeN2外,所有郑州和信阳分离物均与丝瓜专化型、西瓜专化型、甜瓜专化型聚类于同一个亚群。周口分离物可明显的分为2~3个亚群,其中,HeN25、HeN27、HeN28、HeN30和HeN32为单独的亚群,其亲缘关系与黄瓜专化型较近;HeN18、HeN26、HeN29、HeN31、HeN33和HeN34与香蕉专化型的亲缘关系较近。