福建省首株黄热病毒株的分离鉴定和全基因组序列分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ding89629
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目的

从福建省2016年输入性黄热病病例标本中分离黄热病毒(YFV)并分析其生物学特征。

方法

将16份黄热病毒核酸阳性血清、尿液、唾液样品分别接种C6/36细胞,YFV实时荧光RT-PCR法鉴定检测培养物中特异性病毒核酸,通过高通量测序获得病毒全基因序列并绘制系统进化树。

结果

从1例患者发病后3天的血清样品分离到一株病毒,通过YFV实时荧光RT-PCR鉴定为YFV病毒;BLAST分析显示该毒株全基因序列与2016年我国首例输入性黄热病病例中分离得到的毒株CNYF01R/2016(KX268355)序列完全一致;系统进化树显示该毒株与1971年安哥拉流行株Angola71分属同一进化树分支,与疫苗株17D vaccine strain(X03700)存在明显的差异,表明本研究分离到的YFV毒株是属于安哥拉型YFV野毒株。

结论

福建省成功从2016年输入性黄热病病例样品分离到一株安哥拉型YFV毒株。

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