【摘 要】
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为筛选适用于青钱柳(Cyclocarya paliurus (Batal.) Iljinskaja)不同组织器官的稳定内参基因,本研究利用青钱柳花芽的转录组测序数据,选取Actin、CYP、EIF、GAPDH、TUB、TEF和18S rRNA共7个看家基因作为候选内参基因;以根、茎、叶、雌花和雄花为材料,通过实时荧光定量PCR (RT-qPCR)技术对各候选内参基因进行扩增.结合NormFinder、geNorm和BestKeeper等软件分析各候选基因的表达稳定性,用RefFinder综合分析获得适宜的
【机 构】
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南京林业大学林学院,南京林业大学南方现代林业协同创新中心,南京,210037
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为筛选适用于青钱柳(Cyclocarya paliurus (Batal.) Iljinskaja)不同组织器官的稳定内参基因,本研究利用青钱柳花芽的转录组测序数据,选取Actin、CYP、EIF、GAPDH、TUB、TEF和18S rRNA共7个看家基因作为候选内参基因;以根、茎、叶、雌花和雄花为材料,通过实时荧光定量PCR (RT-qPCR)技术对各候选内参基因进行扩增.结合NormFinder、geNorm和BestKeeper等软件分析各候选基因的表达稳定性,用RefFinder综合分析获得适宜的内参基因.结果 表明,不同组织中各内参基因表达稳定性具有一定差别,稳定性综合排序从高到低为EIF＞18S rRNA＞ TEF＞GA PDH＞CY P＞A ctin＞ TUB.但由于EIF较18S rRNA的CT值差异较大,即18S rRNA在各组织中的表达量更高,因此本研究确定18S rRNA为青钱柳荧光定量分析的最适内参基因,为后续相关基因功能性研究奠定理论基础.
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