【摘 要】
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目的：使用单细胞转录组数据绘制胃癌免疫微环境组成图谱，探究胃癌转移过程中MHC-Ⅱ类分子演进缺失的免疫机制。方法：在GEO数据库中获取胃癌原发癌和转移癌单细胞数据集，基于R（4.1.2）、Python（3.7），对该数据集进行分群、拷贝数变异（CNV）、拟时序、基因集变异（GSVA）分析、转录因子分析、非负矩阵分解、免疫细胞细分亚群和基因集富集分析，并结合来自TCGA等数据库的多个公共转录组数据集
【基金项目】
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天津市高等学校大学生创新创业训练计划（202010062016）；
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目的：使用单细胞转录组数据绘制胃癌免疫微环境组成图谱，探究胃癌转移过程中MHC-Ⅱ类分子演进缺失的免疫机制。方法：在GEO数据库中获取胃癌原发癌和转移癌单细胞数据集，基于R（4.1.2）、Python（3.7），对该数据集进行分群、拷贝数变异（CNV）、拟时序、基因集变异（GSVA）分析、转录因子分析、非负矩阵分解、免疫细胞细分亚群和基因集富集分析，并结合来自TCGA等数据库的多个公共转录组数据集，验证所得出的结论。结果：拟时序分析反映MHC-Ⅱ类分子在癌症转移过程中演进缺失，转录因子分析观察到IRF1、STAT1等转录因子在原发癌中的高表达，非负矩阵分解探查到原发癌中独有的干扰素（IFN）γ表达模块，但原发癌展现了较冷的免疫微环境。免疫细胞的亚群分类展示了树突状细胞、巨噬细胞、T细胞等在微环境中的分布。细胞通讯分析显示MDSC样和SPP1+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）抑制了转移癌中IFNγ的分泌并表现了促血管生成活性。基于这两种TAM的生物标志构建的评分在胃癌中具有预后意义（Log-Rank P＜0.05）。scPAGE在较大规模的bulk转录组层面对单细胞分析获得的结果进行了验证。结论：TAM介导IFNγ分泌抑制，其在转移癌较原发癌中分泌相对较少，是MHC-Ⅱ在两者间表达出现差异的原因之一。针对MDSC样TAM和SPP1+TAM的研究可能是肿瘤免疫治疗的另一突破点。
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