半滑舌鳎有效群体大小估计

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【摘要】

：

为了解半滑舌鳎当前的群体遗传结构,探究半滑舌鳎有效群体大小(Ne)发展趋势及现状,实验通过性别特异性分子标记随机鉴定了800尾半滑舌鳎的遗传性别,选取297个遗传雌性半滑舌

【作者】

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王伟峰崔瑜蒋丽王悦玲王焕岭李恒德

【机构】

：

华中农业大学水产学院,中国水产科学研究院生物技术研究中心,上海海洋大学

【出处】

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水产学报

【发表日期】

：

2019年4期

【关键词】

：

半滑舌鳎简化基因组测序(2b-RAD) 连锁不平衡有效群体大小 Cynoglossus semilaevis simplified genome seque

【基金项目】

：

中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2016ZD0203,2016B005).

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为了解半滑舌鳎当前的群体遗传结构,探究半滑舌鳎有效群体大小(Ne)发展趋势及现状,实验通过性别特异性分子标记随机鉴定了800尾半滑舌鳎的遗传性别,选取297个遗传雌性半滑舌鳎样本进行简化基因组测序(2b-RAD),获得了64 416个可用SNP标记,利用这些标记进行全基因组范围的连锁不平衡分析得到各染色体上连锁不平衡分布;根据标记间不同物理间距进行半滑舌鳎有效群体大小的估计,初步了解各历史世代下有效群体规模;通过选择0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0、10.0 Mb等7个不同染色体片段大小反映

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