进入7月，中国部分地区特别是淮河流域连续普降大到暴雨，局部地区出现大暴雨。淮河干流全线超过警戒水位，部分河段超过保证水位，发生了新中国成立以来仅次于1954年的全流域性大洪水，防汛抗洪形势异常严峻。至7月15日，淮河干流已出现两次洪水，形成三次洪峰。据国家防汛抗旱总指挥部办公室统计，截至7月16日，淮河洪灾导致直接经济损失120亿元。
　　在全国防汛的关键时期和淮河防汛抗洪的紧要关头，胡锦涛、温家宝作出重要指示，要求有关地方和部门始终把保护人民群众安全放在第一位，妥善安置蓄洪区内的受灾群众，加强雨情、水情的监测预报，切实做好防汛抗洪各项工作，确保淮河堤防和沿淮地区人民群众安全。
　　7月初，受胡锦涛、温家宝委派，国务院副总理、国家防汛抗旱总指挥部总指挥回良玉深入安徽和湖北灾区，代表党中央、国务院看望慰问奋战在抗洪一线的广大军民，检查指导防汛抗洪救灾工作。他并主持召开国家防总紧急办公会议，进一步安排部署淮河防汛抗洪减灾救灾工作。
　　7月13日，温家宝和回良玉一起来到安徽阜阳，慰问奋战在抗洪救灾一线的广大军民，了解受灾群众的安置情况，并对下一步抗洪救灾工作作出部署。7月14日，淮河防总紧急部署下一阶段防汛工作重点。
　　为加强防汛纪律，安徽省纪委、省监察厅发出紧急通知，要求沿淮地区各级纪检监察机关切实加强对防汛抗洪救灾工作的监督检查，对工作不负责任、玩忽职守、敷衍塞责等行为，要依照党纪政纪的有关规定，从严、从重、从快处理。安徽省颍上县一名村支书作为分管防汛段责任人却擅离职守，已被上级党委撤销党内一切职务。
　　目前安徽省有16.6万名干部群众坚守淮河防汛抗洪第一线，3万多名解放军、武警官兵和民兵预备役人员也日夜坚守在淮河两岸，巡坝固堤，排漏查险。