4种金花茶叶绿体基因组的比较分析

来源 :福建农林大学学报(自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lixinjun678
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利用全基因组重测序数据组装得到了夏石金花茶(Camellia xiashiensis)等4种金花茶的叶绿体全基因组序列,并进行了注释和比较分析。结果表明,4种金花茶植物叶绿体基因组序列高度相似,约为156657~157046bp,均预测注释134个基因,包含89个蛋白编码基因,8个rRNA和37个tRNA;金花茶植物的叶绿体基因组在结构和进化上具有保守性,它们具有相似的密码子偏好性且均未发生大面积的倒位和基因重排;通过叶绿体基因组的比较分析和核苷酸多态性分析发掘了rps16和ycf1等高变异片段,这些片段可尝试作为金花茶植物分子标记之一加以应用;基于金花茶植物叶绿体基因组数据构建的系统进化树具有较高的支持度,表明金花茶叶绿体基因组序列的公布对金花茶植物系统发育的研究具有重要意义。
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