【摘 要】
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目的：基于生物信息学方法分析皮肌炎基因芯片；利用CIBERSORT反卷积算法探究皮肌炎关键基因的免疫浸润机制，并预测其中药治疗靶点。 方法：在GEO数据库检索皮肌炎基因芯片，筛选出差异共表达基因并进行分析；运用R软件包对差异共表达基因进行GO分析、KEGG分析、蛋白质互作网络构建（PPI）；验证关键基因的表达水平；利用 CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润机制；通过医学本体信息检索平台Co
【机 构】
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广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金（ 81773312）； 广东省“扬帆计划引进紧缺拔尖”人才项目（201433005）； 广东省东莞市社会发展科技重点项目（ 20211800905552）；
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目的：基于生物信息学方法分析皮肌炎基因芯片；利用CIBERSORT反卷积算法探究皮肌炎关键基因的免疫浸润机制，并预测其中药治疗靶点。 方法：在GEO数据库检索皮肌炎基因芯片，筛选出差异共表达基因并进行分析；运用R软件包对差异共表达基因进行GO分析、KEGG分析、蛋白质互作网络构建（PPI）；验证关键基因的表达水平；利用 CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润机制；通过医学本体信息检索平台Coremine medical数据库，筛选皮肌炎的中药治疗靶点并进行归纳分析。 结果：共筛选出196个差异共表达基因。GO富集分析显示这些差异共表达基因主要富集在病毒的防御反应、血液微粒、双链RNA结合、多肽抗原结合力等方面；KEGG富集分析显示其主要涉及Rig-I样受体信号通路、Toll样受体信号通路等与皮肌炎发病相关的信号通路。本研究最终得到了STAT1、ISG15、IRF7、IRF9四个皮肌炎关键基因。CIBERSORT算法分析结果显示，M1巨噬细胞（Macrophages M1）、M2巨噬细胞（Macrophages M2）、CD8+T细胞是平均占比最高，免疫浸润最明显的三种细胞；活化的自然杀伤细胞与活化的树突状细胞之间存在较为明显的正相关性，静息的肥大细胞与活化的肥大细胞之间存在较为明显的负相关性。通过Coremine medical数据库筛选出鱼脑石等相关中药治疗靶；归经分析显示这些中药主要集中在肝经、肺经、脾经；功效分析则主要集中在清热、解毒、活血化瘀以及止咳化痰等方面。 结论：本研究通过生物信息学方法得到了STAT1、ISG15、IRF7、IRF9四个皮肌炎关键基因；通过CIBERSORT算法表明其与免疫浸润细胞之间存在较强相关性；筛选出了鱼脑石等具有治疗潜力的中药靶点，为研究皮肌炎的发病机制和治疗方法提供了新的参考。
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