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导航载体上电气设备产生的电磁噪声是影响地磁测量精度的主要因素之一。对电气设备产生的电磁干扰特性进行了深入地研究与分析，将电磁干扰噪声分为高频交变磁扰和等效电流磁扰，并根据其不同的特性采用了不同的降噪方法。首先运用小波阈值法消除高频交变电磁噪声，然后提出了以交变磁扰噪声能量分布脊线为参量，建立消除等效电流磁扰补偿模型的算法。试验证明，该方法不但能起到较好的降噪、平滑效果，而且可以保持真实信号的突变细节，提高了地磁测量的精度。