hsa-miR-106b-5p调控ESR1表达对肝细胞癌患者生存预后的意义

来源 :牡丹江医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shicyh
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目的 利用生物信息学方法,分析hsa-miR-106b-5p调控ESR1在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达及其生存预后意义。方法 利用BART和StarBase数据库筛选GSE108724芯片的差异miRNAs及其与HCC患者生存预后的关系;利用TargetScan和MetaScape数据库分析miRNAs的靶基因及其GO和KEGG富集分析,并利用String数据库和Cytoscape软件筛选靶基因中的HUB基因;对HUB基因进行生存预后分析及其与miRNAs的结合位点分析;通过临床数据构建HUB基因在HCC中的风险预测模型,并利用C-index、校准曲线(CC)、决策曲线分析(DCA)以及ROC曲线对预测模型进行评价。结果 共得到5个差异miRNAs,仅hsa-miR-106b-5p对HCC患者生存预后有显著意义;hsa-miR-106b-5p的靶基因有644个,其KEGG主要富集在Rap1信号通路、MAPK信号通路和癌症信号通路上;GO功能主要富集在跨膜受体蛋白酪氨酸激酶、Ras GTPase结合和分解代谢调控等上;HUB基因中仅ESR1在HCC中低表达,并对HCC患者的生存预后有显著意义,且ESR1 mRNA 3’UTR直接与hsa-miR-106b-5p结合;Logistic回归分析发现低表达的ESR1是HCC患者生存预后的独立危险因素;且所构建的风险预测模型具有较好的准确性和有效性。结论 hsa-miR-106b-5p调控ESR1使其在HCC中低表达,且不利于HCC患者的生存预后,可作为HCC的潜在治疗靶点。
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