为探究克孜勒河5种土著鱼食物组成及其营养级,本研究选取采自于克孜勒河的塔里木裂腹鱼（Schizothorax biddulphi）、宽口裂腹鱼（Schizothorax eurystomus）、厚唇裂腹鱼（Schizothorax irregularis）、叶尔羌高原鳅（Triplophysa yarkandensis）和长身高原鳅（Triplophysa tenuis）5种鱼样品共46尾作为研究对象,运用传统形态学方法,对样品5个摄食器官形态性状进行分析,通过高通量测序技术分析其肠道食物组成,并测定了碳、氮稳定同位素以分析其营养级。研究结果显示, 3种裂腹鱼属鱼类摄食器官形态较为相近, 2种高原鳅摄食器官形态基本一致;厚唇裂腹鱼肠长比约为2.95,主要食物来源于初级生产者,包括刚毛柽柳（Tamarix hispida）、野大豆（Glycine soja）和白刺（Nitraria tangutorum）等;宽口裂腹鱼肠长比较短,约为2.56,食物以初级生产者为主,如二穗短柄草（Brachypodium distachyon）,也会捕食一些小型鱼类;塔里木裂腹鱼肠长比较短,约为2.38,食物以裂腹鱼属鱼类为主,其次为白柠檬（Citruslatifolia）;叶尔羌高原鳅与长身高原鳅比肠长均小于1,肠道中裂腹鱼属鱼类丰度达到95%以上;塔里木裂腹鱼、宽口裂腹鱼和厚唇裂腹鱼营养级分别为3.19、2.78和2.52,叶尔羌高原鳅与长身高原鳅营养级为3.44和3.55;综合判断厚唇裂腹鱼属植食性鱼类,宽口裂腹鱼为杂食性偏植食性鱼类,塔里木裂腹鱼为杂食性偏肉食性鱼类,叶尔羌高原鳅和长身高原鳅为肉食性鱼类。本研究拓展了对克孜勒河食物网的认识,探明克孜勒河鱼类食物关系和营养级,为克孜勒河鱼类资源保护及合理利用提供基础数据。