利用16S rRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法分析肉牛瘤胃上皮细菌群落特征

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zbz963
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目前对于附着于瘤胃上皮的细菌群落及其功能了解较少,本研究目的是利用16SrRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比较分析肉牛瘤胃上皮与瘤胃内容物细菌群落的多样性差异。从6个16SrDNA(~1.4kb)文库中随机选取2785条序列,结果表明3个瘤胃内容物文库与3个瘤胃上皮文库的细菌群落存在差异。以97%的序列相似度进行计算,结果发现瘤胃内容物菌群文库的多样性指数(4.12/4.42/4.88)比瘤胃上皮组织菌群文库的多样性指数(2.90/2.73/3.23)高。厚壁菌门和拟杆菌门分别是瘤胃上皮组
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