目的对3例疑难危重症肺部感染患儿的病原宏基因组检测结果进行分析,探讨其在临床的应用价值。方法对安徽省儿童医院呼吸内科及重症监护室2019年4月至6月收治的3例疑难危重症肺部感染患儿进行常规病原检测的同时,进行外周血(1例患儿同时对肺泡灌洗液标本)进行基于二代测序技术的病原宏基因组检测。结果例1外周血宏基因组检测结果为DNA病毒人类腺病毒B;例2肺泡灌洗液宏基因检测结果为缓症链球菌、肺炎链球菌、结核分枝杆菌复合群、RNA病毒人冠状病毒0C43;外周血宏基因检测结果为结核分枝杆菌复合群;例3外周血宏基因组检测结果为人类腺病毒7型、鲍氏不动杆菌和铜绿假单胞菌。结论随着病原宏基因组检测技术的逐渐成熟,对于疑难危重肺部感染患儿在常规病原学检测基础上尽早进行病原宏基因组检测,并结合临床资料进行综合分析确定为定植菌、背景菌还是致病菌,可为临床精准治疗、及时挽救患儿提供重要参考价值,未来可能在临床广泛应用。